ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЖИВОТНОВОДСТВА — 
ВИЖ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Л.К. ЭРНСТА

ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста


Филиалы:  ВНИИГРЖ ВНИИФБиП Ладожский ИИБЖ ВНИИР
ВКонтакте Инстаграмyoutube

Исследование происхождения и сравнительный анализ следов отбора с использованием отсеквенированных геномов турано-монгольских пород крупного рогатого скота и сибирских пород овец (ФГБНУ ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН)

Назад к инфраструктуре

Проект №: 19-76-20026
Заказчик: 
Российский научный фонд
Исполнитель: ФГБНУ ФИЦ «Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН»
Сроки выполнения: 2019-2022 гг.
Руководитель работ: Ларкин Денис Михайлович
Ссылка на страницу проекта: https://www.rscf.ru/contests/search-projects/19-76-20026

В рамках выполнения проекта предусмотрено проведение исследований на базе инфраструктуры ОНИС БиоТехЖ. С этой целью заключен договор на выполнение научно-исследовательских работ на базе научной инфраструктуры ОНИС БиоТехЖ в соответствии с типовой формой договора на выполнение работ. Стоимость работ определялась, исходя из объема, качества и сложности выполнения работ с учетом стоимости ранее выполненных аналогичных видов работ.

Договор № ЗЕП162.223.2019 от 13.11.2019 г.
№ государственной регистрации: АААА-А19-119111890072-2
Тема: «Популяционно-генетический и филогенетический анализ данных полногеномных профилей домашних животных»
Сроки выполнения: 13.11.2019 – 09.12.2019 г.
Стоимость работ по договору: 200 тыс. рублей
Результаты работы: отчет о НИР на 66 с., 8 рис., 7 табл., 122 источника.

Краткое описание результатов работы:

Объектом исследований являются крупный рогатый скот и овцы.
Целью выполнения работ является проведение исследований по популяционно-генетическому и филогенетическому анализу данных полногеномных профилей домашних животных.
Материалом для исследований являлись образцы ткани двух пород овец; результаты первичного поиска CNV, выполненного Заказчиком с использованием объединенного датасета, включающего генотипы высокой плотности (Ovine HD BeadChip, Illumina Inc., США) 6 пород овец, полученные Заказчиком (тувинская короткожирнохвостая, Буубей, красноярская, горноалтайская, кулундинская, забайкальская) и 9 пород овец, предоставленные ОНИС БиоТехЖ (лезгинская, карачаевская, каракульская, эдильбаевская, русская длинношерстная, грозненская, сальская, волгоградская, осетинская); данные генотипирования крупного рогатого скота алтайской популяции, полученные с использованием ДНК-чипа средней плотности (Bovine SNP50 BeadChip, Illumina Inc., США), предоставленные заказчиком, и 3 пород крупного рогатого скота (якутская, калмыцкая, холмогорская), генотипированных с использованием Bovine SNP50 BeadChip (Illumina Inc., США), предоставленные объектом инфраструктуры ОНИС БиоТехЖ.
В выполнении работ использованы современные биоинформационные методы исследований, включая авторские методики ОНИС БиоТехЖ.
В результате выполнения работ по договору выполнен аналитический обзор 44 научно-информационных источников по теме исследований; получен высококачественный биологический материал для полногеномного секвенирования двух пород овец; выполнена функциональная аннотация районов CNV у российских пород овец (составление списка генов и идентификация генов-кандидатов, которые могли подвергаться отбору); проведен популяционно-генетический (кластерный анализ, многомерное шкалировавние, расчет эффективной численности и т.д.) и филогенетический анализ (построение деревьев, выявление гибридизации) данных SNP вариабельности крупного рогатого скота.
Новизна проведенных исследований заключается в том, что впервые на основании функциональной аннотации CNV у отечественных пород овец идентифицированы гены-кандидаты, которые могли подвергаться отбору в процессе селекции по хозяйственно-полезным признакам и адаптации к региональным условиям окружающей среды. Полученные результаты позволят уточнить демографическую историю пород овец и крупного рогатого скота и найдут применение в разработке программ сохранения отечественных пород домашних животных.

Расширения для Joomla
Если заметили ошибку, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter

Контакты

142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
Тел. +7 (4967) 65-11-63
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ruinfo@vij.ru

Copyrights

2005- © ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
Все права защищены

Разработка и поддержка сайта:
Отдел научно-информационного обеспечения и международного сотрудничества

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru