logo VIJ

ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЖИВОТНОВОДСТВА — ВИЖ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Л.К. ЭРНСТА
ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста

Учеными ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста выполнено исследование геномной архитектуры двух старейших отечественных пород молочного скота

Учеными ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста выполнено исследование геномной архитектуры двух старейших отечественных пород молочного скота

Ученые ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста (д.б.н., академик РАН Зиновьева Н.А., в.н.с., к.б.н. Доцев А.В., в.н.с., к.с.-х.н. Сермягин А.А., в.н.с., к.б.н. Денискова Т.Е., с.н.с., к.б.н. Абдельманова А.С., в.н.с., к.б.н. Харзинова В.Р.) в сотрудничестве с учеными из Венского университета естественных наук (профессор Солкнер Й.), Института геномной биологии Лейбница (PhD Рейер Х., профессор Виммерс К.) и Венского ветеринарно-медицинского университета (профессор Брем Г.) исследовали геномную архитектуру двух старейших отечественных пород крупного рогатого скота — ярославской и холмогорской.

Аборигенные породы скота могут нести специфические «отпечатки селекции», являющиеся отражением адаптации пород к локальным условиям окружающей среды и реакции на используемую стратегию разведения. С использованием ДНК-чипов высокой плотности было выполнено полногеномное генотипирование чистопородных племенных животных, представляющих разные генеалогические линии ярославского и холмогорского крупного рогатого скота. Выбор пород для исследований был неслучаен. Ранее проведенные исследования (Sermyagin A.A. et al., 2018 — https://gsejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12711-018-0408-8 Abdelmanova A.S. et al., 2020 — https://www.mdpi.com/2073-4425/11/8/940) показали, что эти две породы созданы с минимальным участием трансграничных пород и сохранили существенную долю аутентичных компонентов в своем геноме.

Для выявления «отпечатков селекции» были объединены три статистических подхода—расчет индекса фиксации, анализ hapFLK и выявление островов с пробегами гомозиготности. Наряду с подтверждением известных регионов было выявлено по три новых области, находящиеся под давлением отбора, в геноме ярославской и холмогорской пород. Был расширен список генов-кандидатов, ассоциированных с выбранными областями генома, выполнена их функциональная аннотация и оценено возможное участие в искусственном отборе в связи с происхождением и развитием пород.

Полученные результаты могут быть полезны для разработки программ рационального использования и сохранения двух старейших отечественных молочных пород крупного рогатого скота.

Результаты исследований опубликованы в журнале PLoS Onehttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0242200.

Если заметили ошибку, выделите фрагмент текста (побольше) и нажмите Ctrl+Enter