Ученые ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста (к.б.н. Денискова Т.Е. с.н.с., рук. группы, к.б.н. А.В. Доцев, в.н.с., рук. лаб., к.б.н. Форнара М.С., с.н.с., д.б.н., академик РАН Н.А. Зиновьева) в сотрудничестве с учеными из других российских институтов (д.б.н., профессор РАН Селионова М.И., зав. кафедрой РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева, д.с.-х.н.Айбазов А.-М.М., г.н.с. ВНИИОК – филиал ФГБНУ «Северо-Кавказский ФНАЦ»), Германии (PhD Хенри Рейер, профессор Клаус Виммерс) и Австрии (д.б.н. Йохан Солкнер, д.вет.н., профессор, иностранный член РАН Готтфрид Брем) провели первое полногеномное исследование российских локальных пород и популяций коз. Специфические экологические и социокультурные условия привели к созданию различных популяций коз в России. Национальное разнообразие коз включает в себя породы, созданные в результате длительной селекции по продуктивным признакам (пух и шерсть), а также местные породы и популяции, разводимые в системе пасторализм. Исследование было направлено на оценку генетического разнообразия и установление популяционной структуры локальных пород и групп коз России (горноалтайская пуховая, алтайская белая пуховая, дагестанская пуховая, дагестанская аборигенная, карачаевская, оренбургская пуховая и советская шёрстная), генотипированных с использованием ДНК-чипа Illumina Goat SNP50 BeadChip.
Российские популяции коз характеризовались высоким уровнем генетического разнообразия. Несмотря на то, что было выявлено уменьшение эффективных размеров популяции, современные эффективные размеры популяции были больше 100 голов во всех изученных популяциях.
Анализ главных компонентов, изучение структуры генетической сети Neighbor-Net и кластеризация в программе Admixture позволили выявить несколько закономерностей в популяциях российских коз. Прежде всего, наблюдалось генетическое отделение коз карачаевской группы от других популяций. Более того, были высказаны предположения о генетической связи оренбургской и горноалтайской пород коз, а также обнаружено, что дагестанские породы подвергались большому генетическому влиянию советской шёрстной породы.
Кроме того, были изучены генетические взаимосвязи между российскими и мировыми популяциями коз, SNP-профили которых были загружены из базы данных проекта AdaptMap. Так, были показаны генетические взаимосвязи между российскими и турецкими породами коз, которые, вероятно, возникли в результате постдоместикационных событий.
Полученные результаты способствуют более углубленному пониманию генетических взаимоотношений коз, происходящих из Западной Азии и Евразии, и могут быть использованы для разработки программ разведения местных коз для обеспечения их эффективного сохранения и рационального использования.
Результаты исследований опубликованы в журнале Frontiers in Genetics (Q2) — https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2021.708740/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Genetics&id=708740
