ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЖИВОТНОВОДСТВА – ВИЖ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Л.К. ЭРНСТА
ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста


ВКонтакте Инстаграмyoutube

 

news
events
conf_calendar
grants_contest
publications
info
uss
ccu
mass_media

Публикации по проекту № 20-516-00020 (РФФИ)

Zinovieva N.A., Sheiko I.P., Dotsev A.V., Sheiko R.I., Mikhailova M.E., Sermyagin A.A., Abdelmanova A.S., Kharzinova V.R., Reyer H., Wimmers K., Sölkner J., Pleshanov N.V., Brem G. Genome-wide SNP analysis clearly distinguished the Belarusian Red cattle from other European cattle breeds. Animal Genetics2021June 15. doi:  https://doi.org/10.1111/age.13102  WoS — Q1 (импакт-фактор = 3,169), SCOPUS — Q1

Отчет по проекту № 20-76-10006 (РНФ)

Отчет за 2020 год.

В настоящее время в России существует необходимость в получении качественно новых отечественных линий кур, обладающих заданными хозяйственно-полезными признаками. Для получения птиц с повышенным уровнем продуктивности необходим синтез методов работы с культурами клеток и современных наработок в области геномного редактирования и молекулярной генетики. Целью проекта являются научные разработки технологических подходов получения, культивирования и трансформации созданными векторами с системой CRISPR/Cas9 примордиальных половых клеток (PGCs) и их последующей трансплантации в эмбрионы кур с целью нокаутирования целевых генов для получения линии кур с заданными показателями продуктивности. В 2021 год нами был выполнен ряд задач, решение которых направлено на достижение конечной цели проекта.

1. Подобрана опытная группа кур и петухов пушкинской породы в половом соотношении 1♂:6♀. Оценен экстерьерный профиль выборки. Отобран биологический материал (кровь), выделена геномная ДНК.

2. На основании информации международной базы генетических данных NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov) проведен дизайн праймеров для секвенирования участков генов MSTN и G0S2 при помощи компьютерной программы BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).

3. Получены сиквенсы первичной последовательности целевых участков генов MSTN и G0S2 специфичные для экспериментальной выборки кур на генетическом анализаторе Applied Biosystems 3500.

4. Выявлены все потенциальные сайты для модификации системой CRISPR/Cas9 в последовательностях целевых генов MSTN и G0S2, рассчитана эффективность предполагаемой модификации (в зависимости от нуклеотидного состава направляющей РНК). Определены неспецифические сайты связывания (off-target), их количество и позиции в исследуемых участках генов. Проведен анализ рейтинга (score) для каждой направляющей РНК, показывающего количество потенциальных неспецифических сайтов.

5. Для решения задач проекта на базе ВНИИГРЖ в лаборатории молекулярной биологии был создан стерильный бокс для работы с культурой первичных половых клеток кур (PGCs).

6. Разработаны технологические подходы получения первичных половых клеток из куриных эмбрионов.

7. Экспериментальным путем определено оптимальное время и способ взятия PGCs кур (3-4 сутки инкубации из дорсальной аорты эмбрионов (стадия Hamburger Hamilton 14)).

8. По результатам комплексных исследований установлено положительное влияние на пролиферацию и рост PGCs клеток базовой среды KnockOut DMEM/F-12, без L-глутамина (Gibco, Thermo Fisher) с добавлением следующих компонентов в расчет на 500 мл среды (натрия пируват 1М (Applichem), нуклеозиды Embryo Max Nucleosides 100X (Millipore) - 2,5 мл, Human Activin A Recombinant Protein (Gibco, Thermo Fisher) - 25 нг/мкл, Human FGF-basic (FGF-2/bFGF) Recombinant Protein (Gibco, Thermo Fisher) – 10 нг/мкл, Chicken Serum (Gibco, Thermo Fisher) – 2%, 2-меркаптоэтанол (NF, VWR) - 3,9 мкл), антибиотик-антимикотик (Thermo Fisher) до 1Х.

9. Оценена пролиферация и морфология клеток на инвертированном микроскопе Olympus (модель: AHMT, Япония) с использованием программы TOP WIEW при увеличении х400. Подсчет клеток проводился с помощью камеры Горяева с использованием ПО (TOP WIEW). Клетки готовы к дальнейшим модификациям на 21 день культивирования.

Участие в мероприятиях по проекту № 21-66-00007

15-17 июня 2021 г. на базе Краснодарского научно-исследовательского ветеринарного института (КНЦЗВ) состоялась  XV международная научно-практическая конференция «Актуальные проблемы повышения здоровья и продуктивности животных», посвященная 75-летию ФГБНУ КНЦЗВ. Кошкина О.А. выступила с докладом на тему «Разработка системы секвенирования полных митохондриальных геномов овец»

27-28 мая 2021 г. в г. Екатеринбурге на базе ФГБНУ "Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр  Уральского отделения Российской академии наук" состоялась научно-практическая конференция с международным участием "Научные достижения генетики и биотехнологии в ветеринарной медицине и животноводстве". Петров С.Н. выступил с докладом на тему: "Фенотипическая оценка овец ресурсной популяции. Различия роста и развития разных генераций".

Публикации по проекту № 21-66-00007 (РНФ)

Выполнение плановых показателей публикационной активности по проекту (на 19.09.2021)

Год План Всего публикаций
Статьи Тезисы в журналах
(по нараст.) Кол-во С учетом Q1 Кол-во С учетом Q1 Кол-во С учетом Q1
2021 5 5 9 5 9 0 0
2022 10 (15)            
2023 12 (27)            
2024 13 (40)            
Всего 40 5 9 5 9 0 0

(1) Deniskova T.E., Dotsev A.V., Selionova M.I., Reyer H., Sölkner J., Fornara M.S., Aybazov A.-M.M., Wimmers K., Brem G., Zinovieva N.A. SNP-Based Genotyping Provides Insight Into the West Asian Origin of Russian Local Goats. Front. Genet. 2021, 12, 708740. doi: 10.3389/fgene.2021.708740.
URL: https://doi.org/10.3389/fgene.2021.708740
WoS — Q2 (Impact-factor = 3,647), SCOPUS — Q2

(2) Dotsev A.V., Rodionov A.N., Kharzinova V.R., Petrov S.N., Medvedev D.G., Bagirov V.A., Brem, G., Zinovieva N.A. An Assessment of Applicability of SNP Chip Developed for Domestic Goats in Genetic Studies of Caucasian Tur (Capra caucasica). Diversity 2021, 13, 312. doi: 10.3390/d13070312.
URL: https://doi.org/10.3390/d13070312
WoS — Q2 (Impact-factor = 2,465), SCOPUS — Q1

(3) Singina, G.N.; Shedova, E.N.; Lopukhov, A.V.; Mityashova, O.S.; Lebedeva, I.Y. Delaying Effects of Prolactin and Growth Hormone on Aging Processes in Bovine Oocytes Matured In Vitro. Pharmaceuticals 2021, 14, 684. doi: 10.3390/ph14070684.
URL: https://doi.org/10.3390/ph14070684
WoS — Q1 (Impact-factor = 5,863), SCOPUS — Q1

(4) Abdelmanova A.S., Dotsev A.V., Romanov M.N., Stanishevskaya O.I., Gladyr E.A., Rodionov A.N., Vetokh A.N., Volkova N.A., Fedorova E.S., Gusev I.V., Griffin D.K., Brem G., Zinovieva N.A.* Unveiling comparative genomic trajectories of selection in egg-type Russian White and meat-type White Cornish chickens. Biology, 2021, 10(9), 876.  doi: 10.3390/biology10090876
URL:
https://doi.org/10.3390/biology10090876
WoS — Q1 (импакт-фактор = 5,079), SCOPUS — Q1

 
(5) Upadhyay M., Kunz E., Sandoval E., Hauser A., Krebs S., Graf A., Blum H., Dotsev A., Okhlopkov I., Shakhin A., Bagirov V., Brem G., Fries R., Zinovieva N., Medugorac I. Whole genome sequencing reveals a complex introgression history and the basis of adaptation to subarctic climate in wild sheep. Molecular Ecology, 2021, 15 September.  doi: 10.1111/mec.16184.
URL:  https://doi.org/10.1111/mec.16184  
WoS — 
Q1 (импакт-фактор = 6,185), SCOPUS — Q1

 

Контакты

142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
Тел. +7 (4967) 65-11-63
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ruinfo@vij.ru

Copyrights

2005- © ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
Все права защищены

Разработка и поддержка сайта:
Отдел научно-информационного обеспечения и международного сотрудничества

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru