ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
142132, Московская область, г. о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60
Тел. +7(4967) 65-11-63, +7(4967) 65-11-01
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ru, vijinfo@yandex.ru

sm если вы нашли ошибку в тексте, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите (CTRL+Enter)

Статистический и биоинформационный анализ молекулярно-генетических данных

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе GenAlEx, версия 6.4.1 - Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н.
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Structure v.2.3.1. - Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н.
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Cervus - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Анализ митохондриальных аоследовательностей в программе MEGA - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Анализ митохондриальных аоследовательностей в программе UGENE - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Проведение полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) - Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
Подготовка данных по полногеномному SNP генотипированию в программной среде R. - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Контроль качества полногеномного SNP генотипирования с помощью программы PLINK 1.9 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе STRUCTURE 2.3.4 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе Admixture 1.3 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Многомерное шкалирование (MDS) данных по полногеномному SNP генотипированию на основе IBS матриц в программе PLINK 1.9 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева по методу "сети соседей" (Neighbor-Net) в программе SplitsTree 4.14.5 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева (Maximum-likelihood) с миграциями в программе TreeMix 1.13 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет генетических дистанций (Fst, Nei, Jost и т.д.) с помощью программы GENETIX 4.05 и R пакетов "diveRsity", "StAMMP", "adegenet" - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет показателей генетического разнообразия (наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, аллельное разнообразие) в программе GENETIX 4.05 и R пакете "diveRsity" - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет показателя эффективной численности популяции (Ne) с помощью программы SNeP - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Выявление эволюционных моделей нуклеотидных замен в митохондриальной ДНК с помощью программы PartitionFinder 2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение байесовского дерева c учетом эволюционных моделей в программе MrBayes 3.2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение медианной сети гаплотипов мтДНК в программе PopART 1.7 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет времени дивергенции (молекулярные часы) в программе BEAST 2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева по методу "ближайших соседей" (Neighbor-Joining) в программе Phylip 3.695 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Если заметили ошибку, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter

Контакты

142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
Тел. +7(4967) 65-11-63, +7(4967) 65-11-01
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ruvijinfo@yandex.ru 
www.vij.ru
www.vij.edu.ru

Copyrights

2005-2018 © ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
Все права защищены

Разработка и поддержка сайта:
Отдел научно-информационного обеспечения и международного сотрудничества

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru