ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
142132, Московская область, г. о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60
Тел. +7(4967) 65-11-63, +7(4967) 65-11-01
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ru, vijinfo@yandex.ru

sm если вы нашли ошибку в тексте, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите (CTRL+Enter)

Полногеномное SNP-генотипирование животных

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine HD 700 BeadChip (Illumina Inc., USA) Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 777 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine HD 700 BeadChip (https://www.illumina.com/Documents/products/datasheets/datasheet_bovineHD.pdf) Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine GGP 150K BeadChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 150 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine GGP 150K BeadChip (https://support.illumina.com/downloads/geneseek-ggp-bovine-150k-product-files.html) Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine 50K BeadChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 50 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine 50K BeadChip (https://www.illumina.com/Documents/products/datasheets/datasheet_bovine_snp5O.pdf) Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование овец с использованием Ovine HD 600K BedChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования овец по более 600 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Ovine HD 600K BedChip (кастомный чип) Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование овец с использованием Ovine 50K BedChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования овец по более 50 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Ovine 50K BedChip Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование овец с использованием Caprine 60K BedChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования коз по более 60 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Caprine 60K BedChip Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.
Полногеномное SNP-генотипирование свиней с использованием Porcine GGP HD 60K BeadChip Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования свиней по более 60 тыс. полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Porcine GGP HD BeadChip (https://genomics.neogen.com/pdf/slicks/ag284_ggp_porcine.pdf) Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с.

Гистологические исследования

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Отбор и фиксация образцов органов и тканей животных и птицы для гистологических исследований Методика описывает процедуру отбора и фиксации (среды, условия) образцов органов и тканей животных и птицы Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н.
Получение гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы Методика описывает процедуру получения гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н.
Окраска гистологических препаратов гематоксилин-эозином Методика описывает процедуру окраски гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы гематоксилин-эозином Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н.

Микробиологические исследования

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Исследование целлюлозолитических микроорганизмов Определение  качественного и количественного состава целлюлозолитических микроорганизмов в исследуемых биологических объектах Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Определение целлюлозолитической активности микроорганизмов Методика позволяет определить эффективность переваривания клетчатки у сельскохозяйственных животных Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Исследование микробиоты желудочно-кишечного тракта с/х животных и птицы Определение  качественного и количественного состава групп микроорганизмов в биологическом материале Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Исследование клеточных и гуморальных факторов естественной резистентности организма с/х животных Методика позволяет определить основные показатели оценки естественного иммунитета: лизоцимную, бактерицидную, фагоцитарную активность в крови и сыворотке крови Логвинова Т.И., н.с., к.б.н.
Выделение и идентификация микроорганизмов III - IV групп патогенности  Методика позволяет определить видовую принадлежность выделенных штаммов микроорганизмов Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Исследование антибиотикочувствительности и антимикотической резистентности Методика позволяет установить чувствительность выделенных штаммов микроорганизмов к антимикробным и противогрибковым препаратам Никанова Д.А., н.с.
Определение общей токсичности Методика позволяет оценить биобезопасность и установить степень токсичности в кормах и кормовых добавках Давыденкова М.В., м.н.с., к.б.н.
Микробиологический контроль спермы с/х животных Методика позволяет оценить санитарное качество свежеполученной спермы, замороженной, сексированной спермадозы с/х животных и птицы. Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н.
Исследование объектов и факторов окружающей среды  Методика позволяет оценить санитарно-гигиеническое состояние хозяйственно-производственных объектов, воздуха, воды централизованного водоснабжения. Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н.
Выделение  возбудителей мастита, эндомитрита у высокопродуктивных с/х животных Методика позволяет выделить и определить родовую и видовую принадлежность возбудителя данного заболевания из различных биотопов Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Поддержание музейных тест-штаммов в жизнеспособном состоянии Методика позволяет сохранять эталонные штаммы в активном состоянии для последующего использования их в качестве референтных штаммов при проведении микробиологических исследований Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н.
Исследование биологической безопасности по микробиологическим показателям сырья и продуктов его переработки Методика позволяет оценить санитарно-гигиеническое качество сырья и готовой продукции согласно требованиям действующих нормативных документов Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.
Исследование антимикробной активности препаратов, биологически активных добавок Методика позволяет оценить минимальные пограничные концентрации действующего вещества исследуемых препаратов (антимикробных, антиоксидантов, БАД, антимикотических) Никанова Д.А., н.с.
Окраска микррорганизмов по Граму Методика позволяет изучить морфологию клеток. Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н.

Биохимические исследования

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Определение показателей углеводно-липидного обмена в сыворотке крови Определение в сыворотке крови концентрации холестерина, триглицеридов, фосфолипидов. Рыков Р.А., с.н.с.
Определение показателей белкового обмена в сыворотке крови Определение в сыворотке крови концентрации общего белка, альбуминов, общего билирубина, креатинина, мочевины Рыков Р.А., с.н.с.
Определение гематологических показателей в цельной крови Определение содержания эритроцтов, лейкоцитов, гемоглобина и гематокрита в цельной крови Рыков Р.А., с.н.с.
Определение показателей минерального обмена в сыворотке и цельной крови крови Определение в сыворотке крови содержания макро (кальций, фосфор, магний, железо)- и микроэлементов (медь, цинк, селен), щелочной фосфотазы, хлоридов Рыков Р.А., с.н.с.., Волнин А.А., н.с.
Определение общего содержания аминокислот в кормах и биологических субстратах Определение общего содержания аминокислот в кормах и биологических субстратах Волнин А.А., н.с.
Определение содержания свободных аминокислот в биологических субстратах Определение содержания свободных аминокислот в биологических субстратах Волнин А.А., н.с.
Определение ферментативной активности сыворотки крови Определение активности АСаТ и АЛаТ в сыворотке крови Рыков Р.А., с.н.с.
Определение показателей ферментации в рубце Определение в содержимом рубца показателя рН, в рубцовой жидкости - концентрации аммонийного азота, летучих жирных кислот, амилолитической активности Боголюбова Н.В., в.н.с., к.б.н.
Определение химического состава кормов и биологических субстратов (экскрементов, мочи) Определение в кормах и биологических субстратах содержания влаги, сухого вещества, сырого протеина, сырого жира, сырой клетчатки, БЭВ, сахара, крахмала, макро- и микроэлементов. Фомичев Ю.П., г.н.с., д.б.н.

Микроманипуляции с клетками, ооцитами и эмбрионами животных и птиц

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Биопсия эмбрионов крупного рогатого скота Методика описывает проведение прцедуры биопсии эмбрионов на стадии бластоцисты, с последующей подготовкой бипсийного материала для молекулярных исследований (предымплантационной генной диагностики) Лопухов А.А., н.с.
Энуклеация IVM-ооцитов домашних животных Методика описывает проведение процедуры микрохирургического удаления собственного генетического материала (метафазных хромосом) IVM-ооцитов домашних животных Лопухов А.А., н.с.
Подготовка фетальных фибробластов крупного рогатого скота к процедуре клонирования Методика проведения процедуры выделения фетальных фибробластов из плодов крупного рогатого скота, их культивирования, замораживания и субкультивирование, а также синхронизации клеточного цикла Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Подготовка фетальных фибробластов свиней к процедуре клонирования Методика проведения процедуры выделения фетальных фибробластов из плодов свиней, их культивирования, замораживания и субкультивирование, а также синхронизации клеточного цикла Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Получение комплекса ооцит/соматическая клетка Методика описывает проведение процедуры микрохирургического введения соматической клетки в перевителлиновое пространство IVM-ооцитов домашних животных, у которого предварительны хромосомы на стадии метафазы второго деления мейоза Лопухов А.А., н.с.
Слияние и активация комплекса ооцит/соматическая клетка с целью получения клонированного эмбриона крупного рогатого скота Методика описывает проведение электрослияния энуклеированного ооцита и соматической клетки (фетального фибробласта) в составе образуемого ими клеточного комплекса и последующей химической активации образовавшегося цитогибрида Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Слияние и активация комплекса ооцит/соматическая клетка с целью получения клонированного эмбриона свиней Методика описывает проведение электрослияния энуклеированного ооцита и соматической клетки (фетального фибробласта) в составе образуемого ими клеточного комплекса с образованием клонированного эмбриона свиней Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование клонированных эмбрионов крупного рогатого скота Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) клонированных эмбрионов крупного рогатого скота до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование клонированных эмбриона свиней Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) клонированных эмбрионов свиней до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.

Популяционно-генетический анализ, определение и анализ фенотипических признаков животных

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Рачет племенной ценности молочного крупного рогатого скота на основе метода BLUP-Sire Model - Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
Методика оценки показателя конверии корма у свиней на автоматических коромовых станциях - Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.

Генотипирование mtDNA-маркеров животных

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Гентипирование фрагментов mtDNA КРСМетодика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли.Секвенировавание гипервариабельного региона по методу Сэнгера. Акопян Н.А., м.н.с.
Гентипирование фрагментов mtDNA свинейМетодика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли.Секвенировавание гипервариабельного региона по методу Сэнгера. Акопян Н.А., м.н.с.
Гентипирование фрагментов mtDNA овецМетодика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. Петров С.Н., с.н.с.,к.б.н.
Гентипирование фрагментов mtDNA козМетодика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. Петров С.Н., с.н.с.,к.б.н.
Гентипирование фрагментов mtDNA северного оленяМетодика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. Бардуков Н.В., м.н.с.
Видовая идентификация биообразцовМетодика описывает ПЦР-анализ митохондриальной ДНК коров, свиней, овец, кур, индейки, утки с целью видовой идентификации биоматериалаКоновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н.

Получение эмбрионов сельскохозяйственных животных in vitro

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Отбор ооцитов из яичников коров post-mortem Методика описывает порядок и условия отбора и транспортировки яичников от коров и половозрелых телок после их убоя на мясокомбинате, а также последующего выделения и селекции ооцит-кумулюсных комплексов Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Отбор ооцитов из яичников свиней post-mortem Методика описывает условия отбора и транспортировки яичников от свиноматок, половозрелых и препубертатных свинкок после их убоя на мясокомбинате, а также последующего выделения и селекции ооцит-кумулюсных комплексов Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Экстракорпоральное созревание (IVM) ооцитов коров in vitro Методика описывает условия культивирования post-morten ооцитов крупного рогатого скота (в составе ооцит-кумулюсных комплексов) до метафазы второго деления мейоза (IVM-ооциты) Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Экстракорпоральное созревание (IVM) ооцитов свиней in vitro Методика описывает условия культивирования post-morten ооцитов свиней (в составе ооцит-кумулюсных комплексов) до метафазы второго деления мейоза (IVM-ооциты) Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Получение обогащенной фракции активных сперматозоидов из замороженного семени быков методом swim-up Методика описывает условия размораживания семени быков, последующего проведения процедуры swim-up и центрифугирования фракции активных сперматозоидов Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Получение фракции активных сперматозоидов из замороженного семени быков с использованием градиента плонтости Перколла Методика описывает условия размораживания семени быков, приготовления градиенной плотности Перколла, последующего использования его для центрифугирования размороженного семени Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Экстракорпоральное оплодтворение (IVF) созревших in vitro ооцитов коров Методика описывает условия совместного культивирования IVM-ооцитов коров с предварительно полученными методом swim-up или центрифугирования в градиенте плотности Перколла сперматозоидами быков Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Экстракорпоральное оплодтворение (IVF) созревших in vitro ооцитов свиней Методика описывает условия препарирования свежего семени хряков и совместного культивирования полученных сперматозоидов с IVM-ооцитами свиней Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование IVM/IVF ооцитов коров до стадии бластоцисты Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) созревших и оплодотворенных in vitro ооцитов коров ( IVM/IVF ооцитов) до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование IVM/IVF ооцитов свиней до стадии бластоцисты Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) созревших и оплодотворенных in vitro ооцитов свиней (IVM/IVF ооцитов) до стадии бластоцисты (получение IVM/IVF/IVC эмбрионов) Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Замораживание эмбрионов коров, полученных in vitro Методика описывает проведение морфологической оценки и селекции IVM/IVF/IVC эмбрионов крупного рогатого скота и условий их криоконсервации с использованием програмного замораживателя Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Изолирование IVM-ооцитов от окружающих их кумулюсных клеток Методика описывает проведение процедуры освобождения ооцитов от окружающих их соматических клеток Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Партеногенетическая активация IVM-ооцитов коров Методика описывает проведение процедуры химической искусственной активации IVM-ооцитов коров Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Партеногенетическая активация IVM-ооцитов свиней Методика описывает проведение процедуры электроактивации IVM-ооцитов свиней Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование партеногенетических эмбрионов крупного рогатого скота Методика описывает условия культивирования искуственно активированных ооцитов коров до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Культивирование партеногенетичеких эмбрионов свиней Методика описывает условия культивирования искусственно активированнх ооцитов свиней до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Приготовление и анализ суховоздушных препаратов эмбрионов домашних животных Методика описывает подготовку цитологических препаратов развившихся in vitro эмбрионов домашних животных по методу Тарковского, а также последующего их окрашивания и анализа состояния ядерного материала бластомеров Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Приготовление и анализ суховоздушных препаратов IVM-ооцитов коров Методика описывает подготовку цитологических препаратов хромосом в IVM-ооцитах коров по методу Тарковского, а также последующего их окрашивания и анализа Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ состояния хромосом в ооцитах животных с использованием витальных флуоресцентных красителей Методика описывает условия окрашивания и анализа состояния хромосом (стадия мейоза) в ооцитах животных с использованием витального красителя Ноесhst и флуоресцентной микроскопии Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ состояния хромосом в ооцитах и эмбрионах животных с использованием флуоресцентного красителя DAPI Методика описывает подготовку цитологических препаратов ооцитов и эмбрионов, окрашивания их флуоресцентным красителем DAPI, с последующей оценкой состояния хромосом ооцитов (стадии мейоза)и ядерного материала эмбрионов с использованием флуоресцентного микроскопии Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ уровня апоптотической дегенерации в ооцитах и эмбрионах животных Методика описывает проведение детекции апоптотических изменений в ооцитах и эмбрионах у крупного рогатого скота методом TUNEL Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ активности митохондрий в ооцитах коров Методика описывает проведение флуоресцентного анализа активности митохондрий в ооцитах коров с использованием митохондриального флуоресцентного зонда MitoTraker orange Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ ацетилирования гистона 12 по 4 лизину Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 12 по 4 лизину Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ уровня ацетилирования гистона 14 по 3 лизину Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 14 по 3 лизину Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ уровня ацетилирования гистона 9 по 3 лизину Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 9 по 3 лизину Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Химотрепсиновый тест Методика описывает проведение оценки огрубения зоны пеллюцида ооцитов домашних животных Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
анализ активности NO-синтазы (NOS) в ооцитах Методика описывает цитохимический метод оценки активность NO-синтазы (NOS) в ооцитах, определенной на основании активности NADPH диафоразы Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Морфологический анализ эмбрионов крупного рогатого скота и свиней Митодика описывает проведение морфологической оценки дробления эмбрионов и их развитие до стадии бластоцисты Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ экспрессии генов в ооцитах коров Методика описывает подготовку ооцитов к молекулярным исследованиям с последующим проведением оценки уровня экспрессии, связанных с апоптозом, генов (BAX, BCL-2), методом Real-Time PCR Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.
Анализ экспрессии генов в эмбрионах крупного рогатого скота Методика описывает подготовку эмбрионов к молекулярным исследованиям с последующим проведением оценки уровня экспрессии, связанных с апоптозом, генов (BAX, BCL-2), методом Real-Time PCR Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н.

Статистический и биоинформационный анализ молекулярно-генетических данных

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе GenAlEx, версия 6.4.1 - Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н.
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Structure v.2.3.1. - Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н.
Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Cervus - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Анализ митохондриальных аоследовательностей в программе MEGA - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Анализ митохондриальных аоследовательностей в программе UGENE - Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
Проведение полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) - Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
Подготовка данных по полногеномному SNP генотипированию в программной среде R. - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Контроль качества полногеномного SNP генотипирования с помощью программы PLINK 1.9 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе STRUCTURE 2.3.4 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе Admixture 1.3 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Многомерное шкалирование (MDS) данных по полногеномному SNP генотипированию на основе IBS матриц в программе PLINK 1.9 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева по методу "сети соседей" (Neighbor-Net) в программе SplitsTree 4.14.5 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева (Maximum-likelihood) с миграциями в программе TreeMix 1.13 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет генетических дистанций (Fst, Nei, Jost и т.д.) с помощью программы GENETIX 4.05 и R пакетов "diveRsity", "StAMMP", "adegenet" - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет показателей генетического разнообразия (наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, аллельное разнообразие) в программе GENETIX 4.05 и R пакете "diveRsity" - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет показателя эффективной численности популяции (Ne) с помощью программы SNeP - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Выявление эволюционных моделей нуклеотидных замен в митохондриальной ДНК с помощью программы PartitionFinder 2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение байесовского дерева c учетом эволюционных моделей в программе MrBayes 3.2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение медианной сети гаплотипов мтДНК в программе PopART 1.7 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Расчет времени дивергенции (молекулярные часы) в программе BEAST 2 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
Построение филогенетического дерева по методу "ближайших соседей" (Neighbor-Joining) в программе Phylip 3.695 - Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.

Генотипирование селекционно-значимых полиморфизмов крупного рогатого скота

Назад к инфраструктуре

НаименованиеКраткое описаниеОтветственный
Определение полиморфизма гена APAF1, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH1 Методика описывает порядок идентификации аллелей гена APAF1 (OMIA № 000001) обусловленных нуклеотидной заменой C→T локализованой на BTA5, приводящей к аминокислотной замене Q579X в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов рестрикции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH1 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена APOB, ассоциированного с наследственным заболеванием HCD (дефицит холестерина) Методика описывает порядок идентификации аллелей гена APOB (OMIA № 001965), обусловленных инсерцией мобильного LTR элемента (ERV2-1), локализованого на BTA11 в области экзона 5 в образцах ДНК животных при помощи метода АС-ПЦР анализа и электрофоретической детекцией продуктов с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HCD голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
  локализаци 14: 1802265–1802266 динуклеотидная замена A→K (GC→AA) Методика описывает определение полиморфизма гена GHR в позиции A232Kв виде динуклеотидной замены GC→AA посредством пиросеквенирования. Виноградова И.В., с.н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена FANCI, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH0 Методика описывает порядок идентификации аллелей гена FANCI (OMIA №000151 ), обусловленого делецией региона длиной 3,3 кб локализованого на BTA21 в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР анализа с использованием трех праймеров и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH0 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена GART, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH4 Методика описывает порядок идентификации аллелей гена GART (OMIA № 001826), обусловленого миссенсной мутацией A→C локализованой на BTA1 и приводящей к аминокислотной замене N290T в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH4 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена GHR в позиции Y279F Методика описывает определение полиморфизма гена GHR в позиции F279Y (T→A) посредством пиросеквенирования. Виноградова И.В., с.н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена ITGB2, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHB Методика описывает порядок идентификации аллелей гена ITGB2 (OMIA №000595), обусловленых нуклеотидной заменой A→G локализованой на BTA1 и приводящей к аминокислотной замене B128Z в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HHВ голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена SLC35A3, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHC Методика описывает порядок идентификации аллелей гена SLC35A3 (OMIA №001340), обусловленных миссенсной мутацией G599T локализованой на BTA3 и приводящей к аминокислотной замене V180Fв образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертиль ности HHС голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена SMC2, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH3 Методика описывает порядок идентификации аллелей гена SMC2 (OMIA №001824), обусловленных аминокислотной заменой Т→С, локализованой на BTA8, приводящей к аминокислотной замене F→S в позиции 1135 в образцах ДНК животных при помощи метода АС-ПЦР анализа и электрофоретической детекцией продуктов с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH3 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена TFB1M, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH5 Методика определения полиморфизма гена TFB1M, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH5, основана на методе двунаправленной аллелеспецифической ПЦР (АС-ПЦР). Анализ амплифицированных фрагментов ДНК проводится методом гель-электрофореза. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма гена UMPS, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHD Методика описывает порядок идентификации аллелей гена UMPS (OMIA №000262), обусловленных нуклеотидной заменой T→C локализованой на BTA1, приводящей к замене R1247X в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов рестрикции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HHD голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
CSN3 (каппа-казеин) - Ген белка молока, влияющий на молочную продуктивность и качество молока Методика описывает порядок выявения аллелей А и В ? локализованых в экзоне 4 гена CSN3, локализованного на BTA6 , в образцах ДНК животных методом ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления генотипов, обуславливающих различную молочную продуктивность и качество молока у крупного рогатого скота. Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
COLOR- Определение полиморфизма гена MC1R, обуславливающего доминантную черную/ рецессивную красную окраску крупного рогатого скота Методика описывает порядок выявения аллелей E+, ED и е гена MC1R, локализованного на ВТА18 в образцах ДНК животных методом ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления генотипов, обуславливающих доминантное наследование черного цвета над красной мастью у крупного рогатого скота. Гладырь Е.А., в.н.с., к.б.н.
Определение делеции в генах ISG15, HES4, AGRN, ассоциированной с летальным наследственным заболеванием множественный артрогрипоз (AM) Методика описывает проведение анализа генов ISG15, HES4 и AGRN посредством аллельспецефичной ПЦР с целью выявления мутантного аллеля, обуславливающего развитие множественного артрогрипоза у крупного рогатого скота абердин-ангусской породы. Коновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н.
дублированное развитие (не летальный генетический дефект) DD Методика описывает проведение анализа гена NHLRC2 посредством ПЦР-ПДРФ анализа с целью выявления мутантного аллеля, обуславливающего развитие полимелии у крупного рогатого скота абердин-ангусской породы. Коновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н.
Определение полиморфизма в гене SUGT1, Ассоциированного с гаплотипом FH4 симментальского скота Методика разработанной тест-системы анализа полиморфизма гена SUGT1 крупного рогатого скота симментальской породы, ассоциированного с летальным гаплотипом фертильности FH4, основана на проведении ПЦР-ПДРФ -анализа. Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н.
Определение полиморфизма в гене TMEM95, fссоциированного ссубфертильностью быков симментальской породы Методика основывается на идентификации генетической аномалия BMS, локализованной в позиции 652,856 на BTA19 (rs378652941, c.483C>A, p.Cys161X, Chr19: 27,689,622 bp) симментальского скота. Проявляется нонсенс-мутация снижением оплодотворяющей способности семени быков-производителей и пониженной репродуктивной функцией коров-носительниц. Обнаруживается полиморфизм при помощи амплификации фрагмента, содержащего мутацию, с использованием двух праймеров, один из которых мечен биотином с последующим отжигом зонда и пиросеквенированием. Теоретически смоделированные гистограммы и результаты прямого определения последовательности TMEM95 дают возможность различать здоровых животных и носителей мутации. Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н.
Определение полиморфизма в гене RASGRP2, ассоциированного с тромбопатией Методика описывает применяемую тест-систему для определения тромбопатии - миссенс-мутации в гене RASGRP2, наследуемая по аутосомно-рецессивному типу, в результате которой нарушается свёртываемость крови.Определяется методом ПЦР-РТ, основанной на одновременной детекции и количественном определении специфической последовательности ДНК в образце. Метод позволяет выявлять здоровых и животных-носителей. Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н.
ВЛКРС – ПЦР диагностика вируса лейкоза крупного рогатого скота Методика описывает тест-систему, применяемую для диагностика вируса лейкоза крупного рогатого скота с использованием метода "гнездовой" ПЦР Романенкова О.С., н.с., к.б.н.
  • 1
  • 2

Контакты

142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
Тел. +7(4967) 65-11-63, +7(4967) 65-11-01
Факс: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ruvijinfo@yandex.ru 
www.vij.ru
www.vij.edu.ru

Copyrights

2005-2018 © ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста
Все права защищены

Разработка и поддержка сайта:
Отдел научно-информационного обеспечения и международного сотрудничества

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru