| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine HD 700 BeadChip (Illumina Inc., USA) | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 777 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine HD 700 BeadChip (https://www.illumina.com/Documents/products/datasheets/datasheet_bovineHD.pdf) | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine GGP 150K BeadChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 150 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine GGP 150K BeadChip (https://support.illumina.com/downloads/geneseek-ggp-bovine-150k-product-files.html) | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование крупного рогатого скота с использованием Bovine 50K BeadChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования крупного рогатого скота по более 50 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Bovine 50K BeadChip (https://www.illumina.com/Documents/products/datasheets/datasheet_bovine_snp5O.pdf) | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование овец с использованием Ovine HD 600K BedChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования овец по более 600 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Ovine HD 600K BedChip (кастомный чип) | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование овец с использованием Ovine 50K BedChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования овец по более 50 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Ovine 50K BedChip | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование коз с использованием Caprine 60K BedChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования коз по более 60 тыс. Полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Caprine 60K BedChip | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Полногеномное SNP-генотипирование свиней с использованием Porcine GGP HD 60K BeadChip | Методика предусматривает провеение полногеномного SNP-генотипирования свиней по более 60 тыс. полиморфизмов единичных нуклеотидов с использованием Porcine GGP HD BeadChip (https://genomics.neogen.com/pdf/slicks/ag284_ggp_porcine.pdf) | Форнара М.С., с.н.с., к.б.н. Бардуков Н.В., н.с. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Отбор и фиксация образцов органов и тканей животных и птицы для гистологических исследований | Методика описывает процедуру отбора и фиксации (среды, условия) образцов органов и тканей животных и птицы | Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н. |
| Получение гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы | Методика описывает процедуру получения гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы | Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н. |
| Окраска гистологических препаратов гематоксилин-эозином | Методика описывает процедуру окраски гистологических препаратов органов и тканей животных и птицы гематоксилин-эозином | Волкова Н.А., г.н.с., д.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Исследование целлюлозолитических микроорганизмов | Определение качественного и количественного состава целлюлозолитических микроорганизмов в исследуемых биологических объектах | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Определение целлюлозолитической активности микроорганизмов | Методика позволяет определить эффективность переваривания клетчатки у сельскохозяйственных животных | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Исследование микробиоты желудочно-кишечного тракта с/х животных и птицы | Определение качественного и количественного состава групп микроорганизмов в биологическом материале | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Исследование клеточных и гуморальных факторов естественной резистентности организма с/х животных | Методика позволяет определить основные показатели оценки естественного иммунитета: лизоцимную, бактерицидную, фагоцитарную активность в крови и сыворотке крови | Логвинова Т.И., н.с., к.б.н. |
| Выделение и идентификация микроорганизмов III - IV групп патогенности | Методика позволяет определить видовую принадлежность выделенных штаммов микроорганизмов | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Исследование антибиотикочувствительности и антимикотической резистентности | Методика позволяет установить чувствительность выделенных штаммов микроорганизмов к антимикробным и противогрибковым препаратам | Никанова Д.А., н.с. |
| Определение общей токсичности | Методика позволяет оценить биобезопасность и установить степень токсичности в кормах и кормовых добавках | Давыденкова М.В., м.н.с., к.б.н. |
| Микробиологический контроль спермы с/х животных | Методика позволяет оценить санитарное качество свежеполученной спермы, замороженной, сексированной спермадозы с/х животных и птицы. | Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| Исследование объектов и факторов окружающей среды | Методика позволяет оценить санитарно-гигиеническое состояние хозяйственно-производственных объектов, воздуха, воды централизованного водоснабжения. | Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| Выделение возбудителей мастита, эндомитрита у высокопродуктивных с/х животных | Методика позволяет выделить и определить родовую и видовую принадлежность возбудителя данного заболевания из различных биотопов | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Поддержание музейных тест-штаммов в жизнеспособном состоянии | Методика позволяет сохранять эталонные штаммы в активном состоянии для последующего использования их в качестве референтных штаммов при проведении микробиологических исследований | Колодина Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| Исследование биологической безопасности по микробиологическим показателям сырья и продуктов его переработки | Методика позволяет оценить санитарно-гигиеническое качество сырья и готовой продукции согласно требованиям действующих нормативных документов | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Исследование антимикробной активности препаратов, биологически активных добавок | Методика позволяет оценить минимальные пограничные концентрации действующего вещества исследуемых препаратов (антимикробных, антиоксидантов, БАД, антимикотических) | Никанова Д.А., н.с. |
| Окраска микррорганизмов по Граму | Методика позволяет изучить морфологию клеток. | Артемьева О.А., в.н.с., к.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Определение показателей углеводно-липидного обмена в сыворотке крови | Определение в сыворотке крови концентрации холестерина, триглицеридов, фосфолипидов. | Рыков Р.А., с.н.с. |
| Определение показателей белкового обмена в сыворотке крови | Определение в сыворотке крови концентрации общего белка, альбуминов, общего билирубина, креатинина, мочевины | Рыков Р.А., с.н.с. |
| Определение гематологических показателей в цельной крови | Определение содержания эритроцтов, лейкоцитов, гемоглобина и гематокрита в цельной крови | Рыков Р.А., с.н.с. |
| Определение показателей минерального обмена в сыворотке и цельной крови крови | Определение в сыворотке крови содержания макро (кальций, фосфор, магний, железо)- и микроэлементов (медь, цинк, селен), щелочной фосфотазы, хлоридов | Рыков Р.А., с.н.с.., Волнин А.А., н.с. |
| Определение общего содержания аминокислот в кормах и биологических субстратах | Определение общего содержания аминокислот в кормах и биологических субстратах | Волнин А.А., н.с. |
| Определение содержания свободных аминокислот в биологических субстратах | Определение содержания свободных аминокислот в биологических субстратах | Волнин А.А., н.с. |
| Определение ферментативной активности сыворотки крови | Определение активности АСаТ и АЛаТ в сыворотке крови | Рыков Р.А., с.н.с. |
| Определение показателей ферментации в рубце | Определение в содержимом рубца показателя рН, в рубцовой жидкости - концентрации аммонийного азота, летучих жирных кислот, амилолитической активности | Боголюбова Н.В., в.н.с., к.б.н. |
| Определение химического состава кормов и биологических субстратов (экскрементов, мочи) | Определение в кормах и биологических субстратах содержания влаги, сухого вещества, сырого протеина, сырого жира, сырой клетчатки, БЭВ, сахара, крахмала, макро- и микроэлементов. | Фомичев Ю.П., г.н.с., д.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Биопсия эмбрионов крупного рогатого скота | Методика описывает проведение прцедуры биопсии эмбрионов на стадии бластоцисты, с последующей подготовкой бипсийного материала для молекулярных исследований (предымплантационной генной диагностики) | Лопухов А.А., н.с. |
| Энуклеация IVM-ооцитов домашних животных | Методика описывает проведение процедуры микрохирургического удаления собственного генетического материала (метафазных хромосом) IVM-ооцитов домашних животных | Лопухов А.А., н.с. |
| Подготовка фетальных фибробластов крупного рогатого скота к процедуре клонирования | Методика проведения процедуры выделения фетальных фибробластов из плодов крупного рогатого скота, их культивирования, замораживания и субкультивирование, а также синхронизации клеточного цикла | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Подготовка фетальных фибробластов свиней к процедуре клонирования | Методика проведения процедуры выделения фетальных фибробластов из плодов свиней, их культивирования, замораживания и субкультивирование, а также синхронизации клеточного цикла | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Получение комплекса ооцит/соматическая клетка | Методика описывает проведение процедуры микрохирургического введения соматической клетки в перевителлиновое пространство IVM-ооцитов домашних животных, у которого предварительны хромосомы на стадии метафазы второго деления мейоза | Лопухов А.А., н.с. |
| Слияние и активация комплекса ооцит/соматическая клетка с целью получения клонированного эмбриона крупного рогатого скота | Методика описывает проведение электрослияния энуклеированного ооцита и соматической клетки (фетального фибробласта) в составе образуемого ими клеточного комплекса и последующей химической активации образовавшегося цитогибрида | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Слияние и активация комплекса ооцит/соматическая клетка с целью получения клонированного эмбриона свиней | Методика описывает проведение электрослияния энуклеированного ооцита и соматической клетки (фетального фибробласта) в составе образуемого ими клеточного комплекса с образованием клонированного эмбриона свиней | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование клонированных эмбрионов крупного рогатого скота | Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) клонированных эмбрионов крупного рогатого скота до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование клонированных эмбриона свиней | Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) клонированных эмбрионов свиней до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Рачет племенной ценности молочного крупного рогатого скота на основе метода BLUP-Sire Model | - | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| Методика оценки показателя конверии корма у свиней на автоматических коромовых станциях | - | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Гентипирование фрагментов mtDNA КРС | Методика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли.Секвенировавание гипервариабельного региона по методу Сэнгера. | Акопян Н.А., м.н.с. |
| Гентипирование фрагментов mtDNA свиней | Методика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли.Секвенировавание гипервариабельного региона по методу Сэнгера. | Акопян Н.А., м.н.с. |
| Гентипирование фрагментов mtDNA овец | Методика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. | Петров С.Н., с.н.с.,к.б.н. |
| Гентипирование фрагментов mtDNA коз | Методика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. | Петров С.Н., с.н.с.,к.б.н. |
| Гентипирование фрагментов mtDNA северного оленя | Методика описывает проведение анализа полиморфизма d-петли или фрагмента гена Цитохрома B. Секвенировавание фрагмента по методу Сэнгера. | Бардуков Н.В., м.н.с. |
| Видовая идентификация биообразцов | Методика описывает ПЦР-анализ митохондриальной ДНК коров, свиней, овец, кур, индейки, утки с целью видовой идентификации биоматериала | Коновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Отбор ооцитов из яичников коров post-mortem | Методика описывает порядок и условия отбора и транспортировки яичников от коров и половозрелых телок после их убоя на мясокомбинате, а также последующего выделения и селекции ооцит-кумулюсных комплексов | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Отбор ооцитов из яичников свиней post-mortem | Методика описывает условия отбора и транспортировки яичников от свиноматок, половозрелых и препубертатных свинкок после их убоя на мясокомбинате, а также последующего выделения и селекции ооцит-кумулюсных комплексов | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Экстракорпоральное созревание (IVM) ооцитов коров in vitro | Методика описывает условия культивирования post-morten ооцитов крупного рогатого скота (в составе ооцит-кумулюсных комплексов) до метафазы второго деления мейоза (IVM-ооциты) | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Экстракорпоральное созревание (IVM) ооцитов свиней in vitro | Методика описывает условия культивирования post-morten ооцитов свиней (в составе ооцит-кумулюсных комплексов) до метафазы второго деления мейоза (IVM-ооциты) | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Получение обогащенной фракции активных сперматозоидов из замороженного семени быков методом swim-up | Методика описывает условия размораживания семени быков, последующего проведения процедуры swim-up и центрифугирования фракции активных сперматозоидов | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Получение фракции активных сперматозоидов из замороженного семени быков с использованием градиента плонтости Перколла | Методика описывает условия размораживания семени быков, приготовления градиенной плотности Перколла, последующего использования его для центрифугирования размороженного семени | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Экстракорпоральное оплодтворение (IVF) созревших in vitro ооцитов коров | Методика описывает условия совместного культивирования IVM-ооцитов коров с предварительно полученными методом swim-up или центрифугирования в градиенте плотности Перколла сперматозоидами быков | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Экстракорпоральное оплодтворение (IVF) созревших in vitro ооцитов свиней | Методика описывает условия препарирования свежего семени хряков и совместного культивирования полученных сперматозоидов с IVM-ооцитами свиней | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование IVM/IVF ооцитов коров до стадии бластоцисты | Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) созревших и оплодотворенных in vitro ооцитов коров ( IVM/IVF ооцитов) до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование IVM/IVF ооцитов свиней до стадии бластоцисты | Методика описывает условия культивирования (среды и режимы инкубации) созревших и оплодотворенных in vitro ооцитов свиней (IVM/IVF ооцитов) до стадии бластоцисты (получение IVM/IVF/IVC эмбрионов) | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Замораживание эмбрионов коров, полученных in vitro | Методика описывает проведение морфологической оценки и селекции IVM/IVF/IVC эмбрионов крупного рогатого скота и условий их криоконсервации с использованием програмного замораживателя | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Изолирование IVM-ооцитов от окружающих их кумулюсных клеток | Методика описывает проведение процедуры освобождения ооцитов от окружающих их соматических клеток | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Партеногенетическая активация IVM-ооцитов коров | Методика описывает проведение процедуры химической искусственной активации IVM-ооцитов коров | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Партеногенетическая активация IVM-ооцитов свиней | Методика описывает проведение процедуры электроактивации IVM-ооцитов свиней | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование партеногенетических эмбрионов крупного рогатого скота | Методика описывает условия культивирования искуственно активированных ооцитов коров до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Культивирование партеногенетичеких эмбрионов свиней | Методика описывает условия культивирования искусственно активированнх ооцитов свиней до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Приготовление и анализ суховоздушных препаратов эмбрионов домашних животных | Методика описывает подготовку цитологических препаратов развившихся in vitro эмбрионов домашних животных по методу Тарковского, а также последующего их окрашивания и анализа состояния ядерного материала бластомеров | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Приготовление и анализ суховоздушных препаратов IVM-ооцитов коров | Методика описывает подготовку цитологических препаратов хромосом в IVM-ооцитах коров по методу Тарковского, а также последующего их окрашивания и анализа | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ состояния хромосом в ооцитах животных с использованием витальных флуоресцентных красителей | Методика описывает условия окрашивания и анализа состояния хромосом (стадия мейоза) в ооцитах животных с использованием витального красителя Ноесhst и флуоресцентной микроскопии | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ состояния хромосом в ооцитах и эмбрионах животных с использованием флуоресцентного красителя DAPI | Методика описывает подготовку цитологических препаратов ооцитов и эмбрионов, окрашивания их флуоресцентным красителем DAPI, с последующей оценкой состояния хромосом ооцитов (стадии мейоза)и ядерного материала эмбрионов с использованием флуоресцентного микроскопии | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ уровня апоптотической дегенерации в ооцитах и эмбрионах животных | Методика описывает проведение детекции апоптотических изменений в ооцитах и эмбрионах у крупного рогатого скота методом TUNEL | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ активности митохондрий в ооцитах коров | Методика описывает проведение флуоресцентного анализа активности митохондрий в ооцитах коров с использованием митохондриального флуоресцентного зонда MitoTraker orange | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ ацетилирования гистона 12 по 4 лизину | Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 12 по 4 лизину | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ уровня ацетилирования гистона 14 по 3 лизину | Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 14 по 3 лизину | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ уровня ацетилирования гистона 9 по 3 лизину | Методика описывает проведение иммунофлуоресцентного анализа уровня ацетилирования гистона 9 по 3 лизину | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Химотрепсиновый тест | Методика описывает проведение оценки огрубения зоны пеллюцида ооцитов домашних животных | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| анализ активности NO-синтазы (NOS) в ооцитах | Методика описывает цитохимический метод оценки активность NO-синтазы (NOS) в ооцитах, определенной на основании активности NADPH диафоразы | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Морфологический анализ эмбрионов крупного рогатого скота и свиней | Митодика описывает проведение морфологической оценки дробления эмбрионов и их развитие до стадии бластоцисты | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ экспрессии генов в ооцитах коров | Методика описывает подготовку ооцитов к молекулярным исследованиям с последующим проведением оценки уровня экспрессии, связанных с апоптозом, генов (BAX, BCL-2), методом Real-Time PCR | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Анализ экспрессии генов в эмбрионах крупного рогатого скота | Методика описывает подготовку эмбрионов к молекулярным исследованиям с последующим проведением оценки уровня экспрессии, связанных с апоптозом, генов (BAX, BCL-2), методом Real-Time PCR | Сингина Г.Н., в.н.с., к.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе GenAlEx, версия 6.4.1 | - | Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н. |
| Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Structure v.2.3.1. | - | Харзинова В.Р.,в.н.с., к.б.н. |
| Анализ популяционно-генетических параметров по STR в программе Cervus | - | Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н. |
| Анализ митохондриальных последовательностей в программе MEGA | - | Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н. |
| Анализ митохондриальных последовательностей в программе UGENE | - | Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н. |
| Проведение полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) | - | Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н. |
| Подготовка данных по полногеномному SNP генотипированию в программной среде R. | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Контроль качества полногеномного SNP генотипирования с помощью программы PLINK 1.9 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе STRUCTURE 2.3.4 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Кластерный анализ для STR и SNP данных в программе Admixture 1.3 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Многомерное шкалирование (MDS) данных по полногеномному SNP генотипированию на основе IBS матриц в программе PLINK 1.9 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Построение филогенетического дерева по методу "сети соседей" (Neighbor-Net) в программе SplitsTree 4.14.5 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Построение филогенетического дерева (Maximum-likelihood) с миграциями в программе TreeMix 1.13 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Расчет генетических дистанций (Fst, Nei, Jost и т.д.) с помощью программы GENETIX 4.05 и R пакетов "diveRsity", "StAMMP", "adegenet" | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Расчет показателей генетического разнообразия (наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, аллельное разнообразие) в программе GENETIX 4.05 и R пакете "diveRsity" | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Расчет показателя эффективной численности популяции (Ne) с помощью программы SNeP | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Выявление эволюционных моделей нуклеотидных замен в митохондриальной ДНК с помощью программы PartitionFinder 2 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Построение байесовского дерева c учетом эволюционных моделей в программе MrBayes 3.2 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Построение медианной сети гаплотипов мтДНК в программе PopART 1.7 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Расчет времени дивергенции (молекулярные часы) в программе BEAST 2 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Построение филогенетического дерева по методу "ближайших соседей" (Neighbor-Joining) в программе Phylip 3.695 | - | Доцев А.В., в.н.с., к.б.н. |
| Наименование | Краткое описание | Ответственный |
|---|---|---|
| Определение полиморфизма гена APAF1, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH1 | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена APAF1 (OMIA № 000001) обусловленных нуклеотидной заменой C→T локализованой на BTA5, приводящей к аминокислотной замене Q579X в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов рестрикции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH1 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена APOB, ассоциированного с наследственным заболеванием HCD (дефицит холестерина) | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена APOB (OMIA № 001965), обусловленных инсерцией мобильного LTR элемента (ERV2-1), локализованого на BTA11 в области экзона 5 в образцах ДНК животных при помощи метода АС-ПЦР анализа и электрофоретической детекцией продуктов с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HCD голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| локализаци 14: 1802265–1802266 динуклеотидная замена A→K (GC→AA) Методика описывает определение полиморфизма гена GHR в позиции A232Kв виде динуклеотидной замены GC→AA посредством пиросеквенирования. | Виноградова И.В., с.н.с., к.б.н. | |
| Определение полиморфизма гена FANCI, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH0 | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена FANCI (OMIA №000151 ), обусловленого делецией региона длиной 3,3 кб локализованого на BTA21 в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР анализа с использованием трех праймеров и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH0 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена GART, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH4 | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена GART (OMIA № 001826), обусловленого миссенсной мутацией A→C локализованой на BTA1 и приводящей к аминокислотной замене N290T в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH4 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена GHR в позиции Y279F | Методика описывает определение полиморфизма гена GHR в позиции F279Y (T→A) посредством пиросеквенирования. | Виноградова И.В., с.н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена ITGB2, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHB | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена ITGB2 (OMIA №000595), обусловленых нуклеотидной заменой A→G локализованой на BTA1 и приводящей к аминокислотной замене B128Z в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HHВ голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена SLC35A3, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHC | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена SLC35A3 (OMIA №001340), обусловленных миссенсной мутацией G599T локализованой на BTA3 и приводящей к аминокислотной замене V180Fв образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертиль ности HHС голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена SMC2, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH3 | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена SMC2 (OMIA №001824), обусловленных аминокислотной заменой Т→С, локализованой на BTA8, приводящей к аминокислотной замене F→S в позиции 1135 в образцах ДНК животных при помощи метода АС-ПЦР анализа и электрофоретической детекцией продуктов с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HH3 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена TFB1M, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH5 | Методика определения полиморфизма гена TFB1M, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HH5, основана на методе двунаправленной аллелеспецифической ПЦР (АС-ПЦР). Анализ амплифицированных фрагментов ДНК проводится методом гель-электрофореза. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма гена UMPS, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота HHD | Методика описывает порядок идентификации аллелей гена UMPS (OMIA №000262), обусловленных нуклеотидной заменой T→C локализованой на BTA1, приводящей к замене R1247X в образцах ДНК животных при помощи метода ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов рестрикции с целью установления ассоциаций с гаплотипом фертильности HHD голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| CSN3 (каппа-казеин) - Ген белка молока, влияющий на молочную продуктивность и качество молока | Методика описывает порядок выявения аллелей А и В ? локализованых в экзоне 4 гена CSN3, локализованного на BTA6 , в образцах ДНК животных методом ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления генотипов, обуславливающих различную молочную продуктивность и качество молока у крупного рогатого скота. | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
| COLOR- Определение полиморфизма гена MC1R, обуславливающего доминантную черную/ рецессивную красную окраску крупного рогатого скота | Методика описывает порядок выявения аллелей E+, ED и е гена MC1R, локализованного на ВТА18 в образцах ДНК животных методом ПЦР-ПДРФ анализа и электрофоретической детекцией продуктов реакции с целью установления генотипов, обуславливающих доминантное наследование черного цвета над красной мастью у крупного рогатого скота. | Гладырь Е.А., в.н.с., к.б.н. |
| Определение делеции в генах ISG15, HES4, AGRN, ассоциированной с летальным наследственным заболеванием множественный артрогрипоз (AM) | Методика описывает проведение анализа генов ISG15, HES4 и AGRN посредством аллельспецефичной ПЦР с целью выявления мутантного аллеля, обуславливающего развитие множественного артрогрипоза у крупного рогатого скота абердин-ангусской породы. | Коновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| дублированное развитие (не летальный генетический дефект) DD | Методика описывает проведение анализа гена NHLRC2 посредством ПЦР-ПДРФ анализа с целью выявления мутантного аллеля, обуславливающего развитие полимелии у крупного рогатого скота абердин-ангусской породы. | Коновалова Е.Н., с.н.с., к.б.н. |
| Определение полиморфизма в гене SUGT1, Ассоциированного с гаплотипом FH4 симментальского скота | Методика разработанной тест-системы анализа полиморфизма гена SUGT1 крупного рогатого скота симментальской породы, ассоциированного с летальным гаплотипом фертильности FH4, основана на проведении ПЦР-ПДРФ -анализа. | Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н. |
| Определение полиморфизма в гене TMEM95, fссоциированного ссубфертильностью быков симментальской породы | Методика основывается на идентификации генетической аномалия BMS, локализованной в позиции 652,856 на BTA19 (rs378652941, c.483C>A, p.Cys161X, Chr19: 27,689,622 bp) симментальского скота. Проявляется нонсенс-мутация снижением оплодотворяющей способности семени быков-производителей и пониженной репродуктивной функцией коров-носительниц. Обнаруживается полиморфизм при помощи амплификации фрагмента, содержащего мутацию, с использованием двух праймеров, один из которых мечен биотином с последующим отжигом зонда и пиросеквенированием. Теоретически смоделированные гистограммы и результаты прямого определения последовательности TMEM95 дают возможность различать здоровых животных и носителей мутации. | Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н. |
| Определение полиморфизма в гене RASGRP2, ассоциированного с тромбопатией | Методика описывает применяемую тест-систему для определения тромбопатии - миссенс-мутации в гене RASGRP2, наследуемая по аутосомно-рецессивному типу, в результате которой нарушается свёртываемость крови.Определяется методом ПЦР-РТ, основанной на одновременной детекции и количественном определении специфической последовательности ДНК в образце. Метод позволяет выявлять здоровых и животных-носителей. | Филипченко А.А., н.с., к.с.-х.н. |
| ВЛКРС – ПЦР диагностика вируса лейкоза крупного рогатого скота | Методика описывает тест-систему, применяемую для диагностика вируса лейкоза крупного рогатого скота с использованием метода "гнездовой" ПЦР | Романенкова О.С., н.с., к.б.н. |
