Отчет за 2021 год.
В отчетном году изучены показатели роста, развития, яичной и мясной продуктивности, репродуктивные качества перепелов 8 пород в сравнительном аспекте и дана их характеристика по комплексу хозяйственно-полезных признаков. Проведен мониторинг показателей жизнеспособности клеток (уровень клеток с пикнотическими и апоптотическими ядрами) гранулезы овариальных фолликулов самок перепелов. Анализ полученных данных не выявил значимых различий между особями в зависимости от породных особенностей. Также не обнаружено достоверных различий в уровне пикнозов и апоптозов в клетках гранулезы овариальных фолликулов птиц в возрасте 25 и 33 недель. Доля пикнотических клеток в гранулезе исследованных особей составила в среднем 27%, уровень клеток с апоптотическими ядрами достигал 39%. В наших исследованиях впервые показано, что уровень содержания эстрадиола конкретных особей (самок) перепелов коррелирует с показателями деструкции хроматина соматических клеток овариальных фолликулов: низкий уровень апоптозных и пикнотических клеток гранулезы характеризует фолликулы с высоким содержанием эстрадиола. Концентрация эстрадиола была значительно выше у особей, достигших 33 недельного возраста по сравнению с 25 недельными (3,43 пг/мл против 2,27 пг/мл, Р<0,05). В целом показана высокая индивидуальная вариабельность в анализируемых показателях, межпородных различий не выявлено. Выполнено полногеномное генотипирование 8 пород перепелов посредством GBS. Обработка полученных данных позволила отфильтровать для дальнейшего анализа 80673 SNP. Наибольшим уровнем ожидаемой (He) и наблюдаемой (Ho) гетерозиготности, а также аллельного разнообразия характеризовались популяции эстонских и японских перепелов, наименьшие величины аллельного разнообразия и гетерозиготности были установлены у перепелов смокинговой породы. Породы английская белая, английская черная и смокинговая формировали отдельный кластер, также как и породы японская, эстонская, фараон и техасская. Маньчжурская порода характеризовалась обособленностью от остальных пород перепелов. На основании фенотипических данных и результатов генотипирования для проведения полногеномных ассоциативных исследований были выбраны 2 породы, контрастные по показателям мясной и яичной продуктивности, а именно, техасская и японская породы. Данные породы были использованы для получения межпородных гибридов F1. Средняя живая масса полученной птицы F1 составила в возрасте 1 сут, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 недель, соответственно, 8±0,1, 25±1, 54±3, 123±3, 118±3, 201±4, 202±4, 261±4 и 301±4 г у самок и 8±0,2, 20±1, 41±3, 102±4, 117±4, 196±5, 188±3, 244±4 и 258±5 г у самцов. В дальнейшем (этап 2022 г) планируется получение от гибридов F1 ресурсной популяции перепелов F2 для проведения полногеномных исследований в рамках поиска генов и локусов, ассоциированных с хозяйственно-полезными признаками.
Отчет за 2022 г.
В отчетном году получена F2 ресурсная популяция перепелов (n=544). Для создания данной популяции использованы 2 контрастные по показателям продуктивности породы – японский (яичная порода) и техасский (мясная порода) перепела. Первоначально были получены межпородные помеси F1 (японский перепела х техасский перепел), в результате скрещивания которых между собой были получены перепела F2 модельной ресурсной популяции.
Проведено точное фенотипирование полученной ресурсной популяции F2 по показателям роста, развития, мясной продуктивности и функциональной активности соматических клеток овариальных фолликулов. Изучены следующие показатели: живая масса (n=544) и среднесуточные приросты (n=544) от вылупа до 8 недель с еженедельным интервалом, линейные промеры (ширина, глубина, обхват груди, ширина, длина тела, длина киля, бедра, голени) в возрасте 8 недель (n=544), показатели мясной продуктивности (масса тушки и ее составных частей, убойный выход, масса внутренних органов) в возрасте 8 недель (n=142). Живая масса полученной птицы F2 составила в возрасте 1 сут, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 недель соответственно 9±1, 29±1, 70±2, 118±2, 163±3, 200±3, 232±4, 255±4 и 273±4 г у самок и 8±1, 28±1, 68±1, 111±2, 154±2, 187±2, 212±2, 235±2 и 240±2 г у самцов. На основании полученных данных сформирована база фенотипов, которая в последующем будет использована для полногеномных ассоциативных исследований. Установлена высокая вариабельность изученных признаков у исследованных особей F2.
Проведено генотипирование полученной ресурсной популяции перепелов F2 (n=300) методом GBS (genotyping by sequencing). Выполнены тестовые полногеномные ассоциативные исследования показателей роста у перепелов (n=232). На основании проведенного GWAS-анализа идентифицированы 149 SNP на 1-й, 2-й, 3-й, 5-й, 6-й, 8-й, 11-й, 14-й, 15-й, 20-й, 24-й, 25-й и 26-й хромосомах, которые с высокой достоверностью (p < 0,00001) ассоциированы с живой массой. При этом на 1-й, 2-й, 3-й, 5-й, 11-й и 26-й хромосомах детектированы блоки из 2-9 SNP, относящиеся к одному гену. Установлено семь генов-кандидатов (PCDH9, SMAD9, PAN4, EGFR, WDPCP, MDGA2 и PEPD), достоверно (p < 0,00001) связанных с показателем живой массы в возрасте 8 недель. Выявленные SNP могут быть в дальнейшем изучены в качестве генетических маркеров в программах селекции на увеличение массы перепелов, а также в связи с остальными показателями продуктивности.
Полученные данные составят основу для продолжения исследований, направленных на поиск ассоциаций выявленных мутаций с другими селекционно-значимыми показателями продуктивности.
