logo VIJ

ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЖИВОТНОВОДСТВА — ВИЖ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Л.К. ЭРНСТА
ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста

Участие в мероприятиях по проекту № 21-46- 00001 (РНФ)

1. 20.05.2021. г. Москва. Межведомственная рабочая встреча по вопросам мониторинга и рационального использования популяций снежного барана. Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации. Доцев А.В. "Результаты и перспективы генетических исследований снежного барана (Ovis nivicola)". Устный доклад.

 

2. 8-10.07.2021. г. Сочи. Международная конференция. Диалоги о геномике: лучшие практики лабораторий РФ и Европы. Доцев А.В. "Mitochondrial DNA analysis of snow sheep (Ovis nivicola) populations" (Анализ митохондриальный ДНК популяций снежного барана).  Стендовый доклад. 

3. 14-18.07.2021. г. Луисвилл (штат Кентукки, США). Ежегодная конференция Американского и Канадского общества наук о животных (ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show). Доцев А.В. "Genetic characteristics of Karachaev sheep inferred from genome-wide SNP analysis" (Генетическая характеристика карачаевских овец, полученная на основе полногеномного SNP анализа). Стендовый доклад (онлайн)

 

4. 20-23.12.2021. г. Серпухов. Всероссийское совещание по сохранению и рациональному использованию популяций дикого северного оленя, снежного барана и кабарги. Доцев А.В. Генетические исследования снежного барана. Устный доклад

5. 14-18.03.2022. г. Москва.  Конференция с международным участием "Млекопитающие в меняющемся мире: актуальные проблемы териологии" (XI Съезд Териологического общества при РАН). Доцев А.В. Полногеномный SNP анализ структуры популяции и генетического разнообразия снежного барана (Ovis nivicola). Устный доклад
 

Публикации по проекту № 21-16-00049 (РНФ)

Дысин А.П., Баркова О.В., Позовникова М.В. The Role of microRNAs in the Mammary Gland Development, Health, and Function of Cattle, Goats, and Sheep Non-Coding RNA, 7(78), с 1-38. (год публикации - 2021).

Участие в мероприятиях по проекту № 21-76-10038 (РНФ)

24 сентября 2021 г., г. Барнаул состоялся Международный форум "Биотехнологии: наука, образование, индустрия". С докладом выступила Мельникова Е.Е. на тему: "Методы геномной оценки и сравнение эффективности их использования по основным селекционным признакам у свиней".

Отчет по проекту № 21-16-00049 (РНФ)

1. В ходе выполнения плана Проекта в 2021 году были сформированы выборки животных айрширской (6 хозяйств, n=598) по первой лактации, голштинской породы (1 хозяйство, n=152) по 1-4 лактации и коз зааненской породы (1 хозяйство, n=180) по 1-7 лактации. Выборки формировались с учетом даты отела (окота) животного. Ежемесячно в хозяйствах проводили отбор проб молока для оценки качественного состава. Оценивались следующие показатели: Жир (%), Белок (%), Лактоза (%), СОМО (%) (сухой обезжиренный молочный остаток), СВ (%), Казеин В (%), Ацетон (мМоль/л), БГБ (мМоль/л), Мочевина (мгх100мл-1), ТЗ (°С), pH, (миристиновая), C16:0 (пальмитиновая), C18:0 (стеариновая), C18:1 (олеиновая), ДЦЖК (длинноцепочечные ЖК), СЦЖК (среднецепочечные ЖК), КЦЖК (короткоцепочечные ЖК), ПНЖК (полинасыщенные ЖК), МНЖК (мононанесыщенные ЖК), НасЖК (насыщенные ЖК), ТЖК (трансизомеры ЖК), КСК (количество соматических клеток) (тыс. ед/мл), ДКСК (%) (дифференцированное КСК –доля лимфоцитов и полиморфноядерных нейтрофилов в общей сумме клеток в %; доля макрофагов определяется как 100% ДКСК). На основании обобщения массовых сведений была дана сравнительная характеристика айрширской и голштинской породы скота, а также коз зааненской породы по составу молока, содержанию в нем отдельных структурных компонентов. Определены некоторые особенности состава молока, так, например, молоко айрширских коров отличается высоким содержанием жира (в том числе жирных кислот), белка, казеина В. Молоко коз насыщено ПНЖК.

 

2. Проведена линейная экстерьерная оценка для первотелок айрширской породы, а также оценка по дополнительному признаку «ширина задних долей вымени», и классификационной оценки по качеству ног. Рассчитаны индекс вымени UDC (Udder Dairy Composite) и индекс ног FLC (Feet and Legs Compoiste).

3. Получены препараты экзосом из цельного сырого молока коров и коз методом ультрацентрифугирования с дополнительной очисткой на сахарозной подушке. Проведена оценка качества полученных препаратов экзосом методом электронной микроскопии и метода динамического рассеяния (ДЛС).

Отчет по проекту № 21-76-10038 (РНФ)

Отчет за 2021 год.

Получены коэффициенты, свидетельствующие о существенных различиях в доле изменчивости признаков, обусловленной генотипом животных. Наследуемость признака «толщина шпика над 6-7 грудными позвонками» у свиней крупной белой породы находилась на относительно среднем уровне (0,192) и демонстрировала более существенное значение, чем аналогичный показатель у свиней породы ландрас (0,068); околонулевые значения коэффициента наследуемости были характерны для признака «число мумифицированных поросят» у обеих выборок (0,003 и 0,013, соответственно). Относительно высокий уровень наследуемости продемонстрировали признаки «живая масса свиноматки в день взвешивания» (0,717), «живая масса приплода в день взвешивания» (0,478) и «общее число живых поросят в помёте» (0,450) в выборке свиней породы крупная белая. В выборке свиней породы ландрас, наивысшими значениями коэффициентов наследуемости характеризовались признаки «глубина «мышечного глазка» (0,328), «живая масса свиноматки в день взвешивания» (0,339) и «общее число живых поросят в помёте» (0,204). Для проведения анализа ассоциаций были отобраны 51454 (крупная белая) и 48978 (ландрас) SNP, прошедших фильтрацию по всем параметрам качества. Было идентифицирован 37 SNP, достоверно (p<0,00001) ассоциированных с толщиной шпика над 6-7 грудным позвонком у породы крупная белая, а у свиней породы ландрас – 73 SNP. Выявлены гены-кандидаты, отвечающие за: развитие нервной системы и аксоногенез нейронов периферической нервной системы (ген ATXN1, ген NEFH); развитие почек, внутриклеточный транспорт белка и развитие сердца (ген AP1B1); положительную регуляцию процесса катаболизма клеточных белков (ген TNFAIP3); положительную регуляцию дифференцировки жировых клеток (ген CDS1); процесс метаболизма желчных кислот, развитие ткани (ген NR5A2); развитие эмбриональной скелетной системы (ген KIAA1217); организацию цитоскелета (ген FARP1); сенсорное восприятие вкуса (ген ASIC2); развитие системы кровообращения (ген NXN); развитие памяти (ген GRIA1); мозга (ген MACROD2); гомеостаз глюкозы (ген GCK); сперматогенез (ген SPATA6). Гены TNFAIP3, CDS1, AP1B1, NEFH также выявлены у признака «толщина шпика над 10-12 грудным позвонком», а ген CDS1 – у признака «площадь «мышечного глазка». По признаку «площади «мышечного глазка» у породы крупная белая идентифицировано 37 SNP, а у свиней породы ландрас – 8 SNP. Выявлены 3 гена-кандидаты, отвечающих за прогнозирование и молекулярные функции организма (ген PDE4D, ген TRPA1, ген RUNX2). По количеству мумифицированных поросят у крупной белой породы свиней было идентифицировано 53 SNP. Выявлены гены-кандидаты, отвечающие за: вирусный процесс (ген BICD1); развитие коры головного мозга, дифференцировку нейронов (ген TRAPPC9); положительную регуляцию защитного ответа организма на вирус, регуляцию миграции лейкоцитов (ген PTPN22); морфогенез органов животных, развитие тканей, регуляцию развития проекции нейронов (ген NTNG1); развитие сердца, морфогенез ткани сердечной мышцы желудочка, потенциал действия клеток сердечной мышцы желудочка, межклеточную передачу сигналов, участвующих в сердечной проводимости, регуляцию сердечного ритма посредством проводимости, регуляцию потенциала действия клеток желудочковой сердечной мышцы (ген PKP2). По количеству мертворожденных поросят у породы крупная белая выявлено 15 SNP. Идентифицирован ген ARHGAP12, отвечающий за фагоцитоз. У породы ландрас, по данному признаку, выявлено 12 SNP. По показателю живой массы поросят в день отъема выявлено 27 SNP у породы крупная белая, у свиней породы ландрас – 17 SNP. Выявлены гены-кандидаты, отвечающие за: морфогенез организма (ген TP63 и ген LRP5); образование нервно-мышечной ткани (ген FGF12); сенсорное восприятие слуха и двигательный процесс (ген OTOG). Показатель собственной живой массы животного у крупной белой породы идентифицируется 10 SNP, у породы ландрас – 38 SNP. Выявлены гены-кандидаты, отвечающие за: регуляцию дифференцировки жировых клеток (ген TAF8); процесс иммунной системы (ген IRF7); иммунный ответ организма (ген IGF1R). На основании полученных параметров генетического разнообразия были определены корреляционные взаимосвязи признаков на генетическом уровне. Высокая степень взаимосвязи признаков собственной продуктивности (толщина шпика на разных участках, живая масса, глубина мышечного глазка) представляется обусловленной естественными анатомическими особенностями животных. Интерес же представляет статистически значимая взаимосвязь этих признаков с признаками воспроизводства, такими, как число мумифицированных поросят, число живых поросят в помёте, а также масса помёта при отъёме и число отнятых поросят.