Аннотация к проекту № 19-16-00109 (РНФ)

Понимание того, как отбор (естественный, либо искусственный) формирует генетические различия в популяциях сельскохозяйственных животных, имеет фундаментальное значение для эффективного развития животноводства. Отбор вызывает определенные изменения на геномном уровне, которые могут быть использованы для идентификации локусов, подвергнутых селекции, а также причинных мутаций и генов, связанных с изменением биологических процессов, обеспечивающих особенности фенотипической изменчивости. Особый научный интерес представляет идентификация геномным регионов, подверженных естественному или искусственному отбору (называемых «отпечатками отбора», signatures of selection) на основе полногеномного сканирования с помощью чипов высокой плотности. До XX века производство свиней в России происходило в относительно небольших масштабах. Наибольшую активность свиноводство приобрело в конце девятнадцатого века, так в 1980 году в Советском Союзе были зарегистрированы двадцать две местные породы, которые играли важную роль в производстве свинины и экономическом развитии. Несмотря на то, что эти породы основаны на импортном генетическом материале, целенаправленная селекционная работа, сфокусированная на решении определенных задач, диктуемых тем временем, привела к развитию пород с уникальными характеристиками. В связи с распадом СССР и последующими значительными социально-экономическими изменениями, отечественные породы стали практически неконкурентоспособными по сравнению с европейскими коммерческими породами. Это привело к тому, что многие из этих пород, хорошо адаптированные к местному климату, устойчивые к болезням и обладающие высокими качественными показателями мяса, были заменены международными коммерческими породами с более высокой производительностью. Однако на сегодняшний день крайне остро стоит вопрос о создании конкурентоспособных на мировом рынке отечественных племенных ресурсов. Для решения этой задачи ценную информацию можно получить на основе полногеномных исследований отечественных локальных пород свиней и идентификации «отпечатков отбора», используя материал свиней отечественных пород, частично сохранившихся на сегодняшний день, а также образцы из уникальных коллекций биоматериала ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста и черепов, собранных в музее РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева. В связи с этим целью настоящего проекта является идентификация «отпечатков отбора», ответственных или связанных c проявлением хозяйственно-полезных признаков и адаптационных качеств свиней на основе полногеномных исследований дикого поголовья (европейский и азиатский кабан), свиней домашних пород европейского происхождения до глобальной интенсификации свиноводства (конец 20-ого века), локальных отечественных пород (созданных в конце 20-ого века на территории СССР) и современных коммерческих пород. Анализ исследуемых геномных последовательностей позволит идентифицировать целевые локусы и гены, ответственные или связанные c проявлением хозяйственно-полезных признаков и адаптационных качеств, а также прояснить молекулярно-генетические механизмы фенотипического разнообразия. Полученные результаты будут использованы для повышения эффективности управления генетическими ресурсами для производства продуктов животноводства и способствовать быстрому реагированию на текущие и будущие потребности, связанные с изменением климатических условий или появлением новых патогенов, а также диктуемые спросом, обусловленным особыми предпочтениями и сложившимися тенденциями в различных социально-экономических условиях.