Отчет по проекту № 19-016-00068 (РФФИ)

По результатам первого года работы разработана информационная система (база данных) для сбора, учета и хранения первичной зоотехнической и молекулярно-генетической информации; с использованием программы Blupf90 на основе смешанной линейной модели, рассчитаны коэффициенты наследуемости для состояния конечностей, который составили для передних конечностей 0,36 и задних – 0,47. В соответствии с поставленной задачей были построены и проанализированы классификационные модели методами Random Forest (RF) – случайный лес, K-Nearest Neighbors (K-NN) – К-ближайших соседей, искусственные нейронные сети (Neural Networks), C50Tree – дерево решений, SVM – метод опорных векторов, NB – «Наивный» Байес, GLM – обобщенная линейная модель , Boost – модель бустинга и LDA – линейный дискриминантный анализ. В качестве переменной отклика была принята бальная оценка конечностей. Полученные результаты показали возможность применения алгоритмов машинного обучения для оценки состояния конечностей у свиней по показателям ростовых и мясных признаков. Наилучшие прогнозные возможности в нашем наборе данных показали модели Random Forest и K-NN. Определена связь состояния конечностей с признаками откормочной и мясной продуктивности, в качестве значимых предикторов для состояния конечностей установлены показатели среднесуточного прироста, толщины шпика и глубины мыщц. Получены данные о генетических вариантах генов HMGA1 и GH и их ассоциациях с состоянием конечностей у свиней пород крупная белая и ландрас.

Отчет за 2020 г.