L.K. Ernst Federal Science Center for Animal Husbandry

smFound a typo? Please select it and press (CTRL+Enter)

Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object (AnBioTech SIO)

Brief information on Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object

Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object (AnBioTech SIO) was created according to the Ernst VIZh Federal Science Center Order no. 165 as of December 28, 2017 to perform the biotechnology surveys of the farm animals, the quarry, and the relative animal species. This object is based on combining the VIZh institute’s infrastructure units, as follows:
Center for Collective Use of Scientific Equipment (CCU), Farm Animal Bioresources and Bioengineering (December 01, 2008; registration no. 3221, Ministry of Education and Science, Russian Federation)
Unique Scientific Set (USS), Gene Pool of Animal and Bird Genetic Material (created December 30, 2016; registration no. 498808, Ministry of Education and Science, Russian Federation)
Laboratory Experiment Base involves the special rooms designed to perform the surveys of different types including the pedigree genetic material expertise (Certificate of Molecular Genetics Laboratory Registration no. 502512830000 as of November 9, 2017, State Register of Breeding) and work-ups of pathogenic microorganisms of Risk Groups III and IV.

Users of AnBioTech SIO can access the developed methods, the created and maintained livestock resource population datasets, and the databases of the genetic (STR, DNA markers linked to QTL, and the genes associated with inherited diseases), genomic (mitochondrial genomes and whole genome SNP markers), and phenotypic variations (including the mass spectrometry of tissues) in the farm animals and avian species. The objectives of the AnBioTech SIO are to improve the unique equipment efficiency, the scientific installations, and the specialized rooms and to provide the external user access to the methods for variations, the resource (model) population datasets, and the databases of genetic, genomic, and phenotypic variations in the farm animals and avian species to perform R&D to basic and applied research.
The directions of research based on AnBioTech SIO are:
Animal Molecular Genetics, Head is O. V. Kostynina, Doctor of Biological Sciences, Principal Scientist;
Population Genetics and Animal Breeding, Head is A. A. Sermyagin, Candidate of Agricultural Sciences, Principal Scientist;
Bioinformatic Molecular Data Analysis, Head is A. V. Dotsev, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Experimental Embryology, Head is G. N. Singina, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Avian Cell Engineering, Head is N. A. Volkova, Doctor of Biological Sciences, Professor, Russian Academy of Sciences, Chief Scientist;
Farm Animal Biochemistry, Head is N. V. Bogolyubova, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist;
Microbiology, Head is O. A. Artemieva, Candidate of Biological Sciences, Principal Scientist.

The order to create the Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object Regulation for the Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object Development program of the Animal Biotechnology Scientific Infrastructure Object Center for Collective Use of Scientific Equipment (CCU), Farm Animal Bioresources and Bioengineering Unique Scientific Set (USS), Gene Pool of Animal and Avian Genetic Material
Laboratory Experiment Base
Databases of genotypic and phenotypic variations
Database NameBrief Description of DatabaseResponsible Person
1 Database of STR Variation in Domestic Cattle Breeds (Bos taurus) The database contains the information on the cattle breed and population genotypes for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 10 thousand specimens of 17 breeds Volkova, V.V., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist
2 Database of STR Variation in Domestic Yak (Bos mutus) The database contains the information on the genotypes of different yak ecotypes for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 200 heads of yak of 4 different ecotypes. Gladyr, E.A., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
3 Database of STR Variation in European Wisent (Bison bonasus) The database contains the information on the genotypes of different wisent populations for 12 Bos taurus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 100 heads of wisent of 4 different populations. Kostyunina, O.V., Doctor of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
4 Database of STR Variation in Domestic Swine (Sus Scrofa) The database contains the information on the different swine breed and population genotypes for 12 Sus Scrofa microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 20 thousand specimens of 15 breeds. Kharzinova, V.R., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
5 Database of STR Variation in Domestic Sheep (Ovis aries) The database contains the information on the different sheep breed and population genotypes for 12 Ovis aries microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 3 thousand specimens of 35 breeds. Deniskova, T.E., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
6 Database of STR Variation in Bighorn Sheep (Ovis nivicola) Markers The database contains the information on the different Bighorn sheep genotypes for 12 Ovis Aries microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 200 specimens of 5 different Bighorn Sheep subspecies. Deniskova, T.E., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
7 Database of STR Variation in Domestic Goats (Capra chircus) The database contains the information on the goat breed and population genotypes for 9 Capra chircus microsatellite loci recommended by ISAG. The database contains the DNA profiles for more than 300 specimens of 4 breeds. Petrov, C.N., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist
8 Database of STR Variation in Reindeer (Rangifer tarandus) The database contains the information on the reindeer breed and population genotypes for 9 Rangifer Tarandus microsatellite loci. The database contains the DNA profiles for more than 400 specimens of 4 breeds of domestic reindeer and 7 populations of wild reindeer. Kharzinova, V.R., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
9 Database of STR Variation in Honeybee (Apis melifera) The database contains the information on the honeybee breed and population genotypes for 9 Apis mellifera microsatellite loci. The database contains the DNA profiles for more than 1000 specimens of 4 breeds of honeybee. Fornara, M.C., Candidate of Biological Sciences, Senior Staff Scientist
10 Database of Genome Variation in Domestic Cattle Breeds The database contains the information on the whole-genome SNP profile of different cattle breeds and populations produced with the use of both the moderate-density DNA chips: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 thousand. SNP) and Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 thousand. SNP) and the high-density DNA chips: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 thousand SNP). The database contains the DNA profiles for more than 200 heads of cattle of 10 breeds. Dotsev, A.V., Candidate of Biological Sciences, Lead Staff Scientist
11 База данных геномной вариабельности племенных быков-производителей и коров голштинской, черно-пестрой и симментальской пород База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях быков-производителей и коров голштинской, черно-пестрой и симментальской пород, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1000 голов крупного рогатого скота. Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
12 База данных геномной вариабельности зубра База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях ппопуляций зубра, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и Bovine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>150 тыс. SNP) и высокой плотности: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 50 голов зубра. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
13 База данных геномной вариабельности свиней пород крупная белая, ландрас и дюрок База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях хряков-производителей и свиней пород крупная белая, ландрас и дюрок, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Porcine HD BeadChip, GeneSeek/Neogen (>60 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1500 голов свиней. Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
14 База данных геномной вариабельности домашних овец База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях овец различных пород, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Ovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и высокой плотности (Ovine HD BeasdChip, Illumina (>600 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 700 голов овец. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
15 База данных геномной вариабельности диких Ovis База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных диких видов Ovis - архара, муфлона, уриала, снежного барана, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Ovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и высокой плотности (Ovine HD BeasdChip, Illumina (>600 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 250 голов диких Ovis. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
16 База данных геномной вариабельности Capra База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных пород домашних коз и диких видов Capra - кавказского тура, сибирского козерога, мархура и др., полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Caprine SNP60 BeadChip, Illumina (>60 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более 90 голов домашних диких Capra. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
17 База данных геномной вариабельности северного оленя База данных содержит информацию о полногеномных SNP-профилях различных домашних и диких популяций северного оленя, полученных с использованием ДНК-чипов средней плотности: Bovine SNP50 BeadChip, Illumina (>50 тыс. SNP) и и высокой плотности: Bovine HD BeadChip, Illumina (>700 тыс. SNP). В базе данных имеются ДНК-профили более1000 голов крупного рогатого скота. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
18 База данных последовательности цитохрома B (CytB) снежного барана (Ovis nivicola) База данных содержит информацию о полной последовательности цитохрома B различных подвидов и группировок снежного барана. В базе данных имеются последовательности CytB более150 голов снежного барана. Костюнина О.В., в.н.с., д.б.н.
19 База данных последовательности полного митохондриального генома снежного барана (Ovis nivicola) База данных содержит информацию о последовательности полного митохондриального генома различных подвидов и группировок снежного барана. В базе данных имеются последовательности CytB более100 голов снежного барана. Доцев А.В., в.н.с., к.б.н.
20 База данных происхождения, хозяйственно-полезных признаков и показателей экстерьера коров База данных содержит информацию о родословной, уровне развития хозяйственно-полезных признаков (молочная продуктивность, показатели воспроизводства, показатели здоровья) и экстерьерных показателях коров из племенных заводой РФ. В базе данных содержится информация о более 100 тыс. коров. Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
21 Базза данных инфракрасных спектров молока коров База данных сожержит информацию о более 15 показателях, полученных при анализе проб молока коров с использованием инфракрасного детектора. В базе данных содержится информация о ИК-показателях молока более 10 тыс. коров. Сермягин А.А., в.н.с., к.с.-х.н.
22 База данных ежедневных индивидуальных показателей живой массы, потребления корма и показателей кормового поведения свиней База данных сожержит информацию о ежедневных индивидуальных показателях живой массы, потребления корма и 5 признаков кормового поведения хряков породы дюрок. В базе данных содержится информация о более 200 свиней. Белоус А.А., м.н.с.

 

Research infrastructure plan

 

Название фондаНомер проектаНазвание проекта
(интерактивная ссылка)
Сроки выполнения
РФФИ 13-04-01888 Изучение роли эндокринных факторов в регуляции цитологических и молекулярных механизмов старения ооцитов млекопитающих 2013-2015
ГЗ 0600-2014-0005.4 Разработать эффективные способы идентификации свиней с повышенной племенной ценностью на основе генотипирования по ДНК-маркерам 2014-2016
Минобрнауки России 14.604.21.0062 Моделирование панелей молекулярно-генетических маркеров и разработка тест-систем их идентификации на основе технологий генного и геномного анализа для раннего отбора сельскохозяйственных животных по хозяйственно- и экономически значимым признакам (шифр проекта «2014-14-576-0057-175») 2014-2016
РНФ 14-36-00039 Изучение, сохранение и рациональное использование биоразнообразия животных как основы получения здоровой, безопасной и высококачественной пищи 2014-2016
РФФИ 14-48-03681 Идентификация путей сохранения полноценности яйцеклеток в системе оплодотворения in vitro как способ повышения их потенциала к эмбриональному развитию 2014-2016
Министерство инвестиций и инноваций Московской области 76/07-16 Создание усовершенствованной системы геномной оценки молочного скота в Московской области с целью получения племенного материала с высоким генетическим потенциалом по продуктивным, воспроизводительным качествам и показателям здоровья 2016
Министерство инвестиций и инноваций Московской области 78/07-16 Разработка программы разведения молочного скота голштинской и черно-пестрой пород на основе моделирования индексов племенной ценности для совершенствования селекционного процесса в Московской области 2016
РНФ 15-16-00020 Изучение молекулярных и генетических аспектов заболеваемости маститом высокопродуктивных молочных коров как основа разработки новых подходов к предотвращению заболевания 2015-2017
РФФИ 15-08-99473 Роль гормональных и цитологических факторов в регуляции процессов, детерминирующих компетенцию ооцитов к репрограмированию соматического ядра и активации эмбрионального генома 2015-2017
РФФИ 16-34-00875 Изучение роли тиреоидных гормонов в регуляции овариальной функции у жвачных животных в условиях метаболического стресса 2016-2017
ГЗ, ФАНО АААА-А17-117120800069 Инвентаризация и развитие криобанка семени млекопитающих 2017
РНФ 15-16-10069 Изучение механизмов, регулирующих завершение созревания ооцитов, как основа для разработки новых подходов к получению in vitro эмбрионов сельскохозяйственных животных 2016-2018
РНФ 15-16-10059 Изучение молекулярных основ создания генетически модифицированной сельскохозяйственной птицы с целью получения функциональных продуктов с заданными свойствами 2016-2018
РНФ 15-16-10068 Характеристика аллелофонда северного оленя (Rangifer tarandus) на основе данных микросателлитного и полногенномного анализа в аспекте сохранения биоразнообразия и рационального использования диких популяций, и совершенствования селекционно-племенной работы в оленеводстве 2016-2018
РНФ 15-16-04104 Разработка технологий криоконсервации зародышевых и половых клеток сельскохозяйственной птицы разных видов и создание криобанков как формы сохранения генетических ресурсов ex situ 2016-2018
РНФ 14-36-00039П Изучение, сохранение и рациональное использование биоразнообразия животных как основы получения здоровой, безопасной и высококачественной пищи 2017-2018
РФФИ 17-44-500324 Изучение метаболических путей и механизмов регуляции синтеза компонентного состава молока коров на основе полногеномного скрининга и инфраспектрометрического анализа для создания новых селекционных форм животных 2017-2018
Министерство инвестиций и инноваций Московской области   Усовершенствование системы получения клонированных эмбрионов коров с повышенной жизнеспособностью как основы для разработки технологий тиражирования лучших генотипов и геномного редактирования сельскохозяйственных животных 2018
Минобрнауки России 14.604.21.0182 Разработка технологии генетической оценки племенных свиней по хозяйственнополезным признакам на основе методов генного и геномного анализа и высокоточной массспектрометрии для обеспечения конкурентоспособности отечественного племенного свиноводства 2017-2019
РНФ 15-16-00020П Изучение молекулярных и генетических аспектов заболеваемости маститом высокопродуктивных молочных коров как основа разработки новых подходов к предотвращению заболевания 2018-2019
РФФИ 18-516-00008 Исследование генетического разнообразия российской и белорусской популяций европейского зубра (Bison bonasus) и разработка селекционной стратегии его сохранения на основе использования молекулярно-генетической информации 2018-2019
ГЗ 0600-2018-0014 Изучение структурной и функциональной изменчивости животных и птиц на основе использования ДНК-маркеров с целью оценки аллельного биоразнообразия и идентификации ценных генотипов для внедрения в селекционный процесс 2018-2020
РНФ 18-16-00079 Полногеномный анализ ассоциаций показателей роста, развития и частоты рекомбинации в ресурсных популяциях рода Ovis, полученных при межвидовом и межпородном скрещивании 2018-2020
РФФИ 17-29-08015 Поиск локусов количественных признаков (QTL) и генов-кандидатов, ассоциированных с интенсивностью роста овец 2018-2020
РФФИ 17-29-08030 Разработка системы геномной оценки племенной ценности скота симментальской породы в рамках генетического мониторинга племенных ресурсов по признакам молочной продуктивности, фертильности и здоровья 2018-2020
РФФИ 17-29-08035 Идентификация компонентов системы регулирующей созревание и оплодотворение ооцитов как способ программирования эмбрионального развития при получении эмбрионов крупного рогатого скота in vitro 2018-2020
РФФИ 18-016-00050 Идентификация селекционно-значимых полиморфизмов, детерминирующих воспроизводительные качества свиней материнских пород 2018-2020
РФФИ 18-016-00227 Метаболический профайлинг как научная основа для прогнозирования репродуктивного потенциала коров молочного направления 2018-2020

 

Infrastructure-based services for interests of institutions from the real sector of economy

 

Наименование предприятияРегионТема
(интерактивная ссылка)
Сроки выполнения
ООО «Союз-Агро» Ростовская обл. Провести комплексные научные исследования стада ООО «Союз-Агро» и разработать перспективный план селекционно-племенной работы с крупным рогатым скотом черно-пестрой породы на 2017-2021 гг. 2017
АО "ПЗ им. А.С. Георгиевского" Орловская обл. Проведение научных исследований стада АО ПЗ им. А.С. Георгиевского и разработка перспективного плана селекционно-племенной работы с крупным рогатым скотом черно-пестрой породы на 2018–2022 гг. 2018
ЗАО «Племзавод «Разуменский» Белгородская обл. Проведение комплексных научных исследований стада ЗАО «Племзавод «Разуменский» и разработка перспективного плана селекционно-племенной работы с крупным рогатым скотом красно-пестрой породы на 2019–2023 гг. 2018
АО "ПЗ им. А.С. Георгиевского" Орловская обл. Проведение комплексных научных исследований стада АО ПЗ им. А.С. Георгиевского и разработка перспективного плана селекционно-племенной работы с крупным рогатым скотом симментальской породы на 2018–2022 гг. 2018
АО "ПЗ им. А.С. Георгиевского" Орловская обл. Проведение комплексных научных исследований стада свиней ливенской породы АО «Племенной завод им. А.С. Георгиевского» и разработка перспективного плана селекционно-племенной работы на 2016–2022 гг. 2018
ООО "Селекционно-гибридный центр" Воронежская обл. Разработка технологии генетической оценки племенных свиней по хозяйственно-полезным признакам на основе методов генного и геномного анализа и высокоточной масс-спектрометрии для обеспечения конкурентоспособности отечественного племенного свиноводства 2017-2019

 

№0600-2014-0005.4.
List of applied methods
List of standard research work and (or) service delivery
Access equipment regulations and standard contracts for research projects (service delivery)
 
 
 
 
Joomla Plugins
Found a typo? Please select it and press Ctrl + Enter.

Contacts

Dubrovitsy 60, Podolsk Municipal District, Moscow Region, 142132 Russia
7(4967) 65-11-63, +7(4967) 65-11-01
Fax: +7(4967) 65-11-01
E-mail: priemnaya-vij@mail.ruvijinfo@yandex.ru 
www.vij.ru
www.vij.edu.ru

Copyrights

2005-2018 © L.K. Ernst Federal Science Center for Animal Husbandry
All rights reserved

Website development and support:
Department of scientific information support and international cooperation

Яндекс.Метрика Рейтинг@Mail.ru