Сужение генетического разнообразия в природе вследствие социально-экономического или антропогенного воздействия ведет к потере ценных качественных и количественных признаков у особей, что в свою очередь понижает адаптационные способности и выживаемость видов (пород животных). В связи с этим, раскрытие генетических механизмов реакции особей на воздействие разной интенсивности и направления искусственного отбора (селекции) и паратипических условий представляется важной задачей в деле сохранения генофонда. Малочисленные и исчезающие породы крупного рогатого скота так называемого красного корня в России и Беларуси (а также на пространствах СНГ и стран бывшего СССР) в настоящий момент подвергаются генетической эрозии, которая затрагивает как популяционные аспекты развития пород, так и изменения на геномном уровне: снижение эффективной численности популяции, потеря уникальных аллелей и их сочетаний, высокая степень наличия генов трансграничных пород. Вместе с этим неясным остается процесс формирования уникальных качеств животных красной белорусской, красной горбатовской, суксунской, бестужевской и красной степной, которые отвечают за приспособительные реакции к высоким эксплуатационным нагрузкам: долголетнее использование, высокие воспроизводительные качества, резистентность к ряду заболеваний (лейкоз, туберкулез). Впервые будет проведен полногеномный анализ с использованием биочипов высокой плотности (777 тыс. SNP) для изучения аллелофонда красных пород скота и поиска отпечатков селекции в геноме. Будет дана оценка уровня гомозиготности, неравновесия по сцеплению и эффективного размера численности в исследуемых популяциях с целью определения недавних демографических событий, повлиявших на формирование современного генофонда. Также будет представлена характеристика генетической дивергенции пород красного корня, определены популяционные константы. Изучение уникального генофонда красных пород России и Беларуси, имеющих сходство по своему происхождению, но разную реакцию на средовые условия, через комплексный подход по исследованию генетических механизмов изменчивости количественных и качественных параметров скота является важной научной задачей.